rcpp

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在Armadillo矩陣中有概率的向量化Rcpp rbinom

我有一個概率對稱矩陣，對角線條目爲null。假設像 0 0.5 0.1 0.6 0.5 0 0.2 0.1 0.1 0.2 0 0.2 0.6 0.1 0.2 0 我想畫一個虛擬矩陣，以使進入的概率[I，J]是概率矩陣項[I，J]。請注意，我擁有的概率矩陣是一個犰狳矩陣（一個大矩陣5000x5000）。當然，對角虛擬角色應該爲空，因爲它們的概率爲零。我建立了兩個功

r matrix rcpp armadillo 2017-10-09

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RCPP警告：呼籲 'EXP' 不明確

我寫如下一個RCPP代碼： // [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]] // [[Rcpp::depends(BH)]] // [[Rcpp::plugins(cpp11)]] #include <RcppArmadillo.h> #include <boost/random.hpp> #include <boost/random/uniform_real_

c++ r rcpp 2017-10-09

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在N維數組中的邊距最快的總和：apply（X，MARGIN = c（1,2），sum）

我有一個4維數組，我需要計算兩個維的和。我看到apply出奇的慢。 我曾嘗試compiler庫，但速度幾乎提高： library(compiler) X <- array(2, dim=c(1000,20,10,125)) suma <- function(X){ apply(X, MARGIN=c(1,2), sum) } suma.cmp <- cmpfun(suma)

r rcpp 2017-10-10

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如何使用RCPP避免r中

使用循環我有一個XTS格式的數據（數據）是這樣的： A 2008-01-14 09:29:59 10 2008-01-14 09:29:59 0.1 2008-01-14 09:30:00 0.9 2008-01-14 09:30:00 0.1 2008-01-14 09:30:00 0.2 2008-01-14 09:30:00 0.4 200

r function for-loop rcpp xts 2017-10-10

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在Rcpp中製作帶有arma :: cube的三維數組顯示多維數據集錯誤

我正在製作用於吉布斯採樣的Rcpp代碼。在代碼裏面，我首先要創建一個三維數組，其中行數=迭代次數（500），列號=參數數量（4），切片數量=鏈數（3）。我這樣寫： #include <RcppArmadillo.h> #include <math.h> // [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]] using namespace Rcpp; using na

arrays r rcpp bayesian 2017-10-11

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在R中的大數據文件上優化循環，也許使用Rcpp

我在R中有一個很慢的循環（但工作）。目前，我的筆記本計算需要約3分鐘，我認爲這可以提高。最後，我將循環執行基於此代碼的結果進行計算的許多數據文件，並且如果可能的話，我希望儘快使當前代碼更快。基本上，對於每個日期，對於X的11個不同值，循環抓取最後X年的降雨量值（Y），找到線性逆加權值（Z），使得最老的降雨量值加權最小，將雨（Y）和權重（Z）乘以得到向量A，然後將A的總和作爲最終結果。這是爲數千個日

r performance loops rcpp 2017-10-11

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Rcpp - 加速和while循環內的隨機正常繪製

我是Rcpp的新手，並探索其應用程序。特別是，我試圖加快下面的函數，部分建立在一個previous answer： code = 'NumericVector RcppFun(int N){ NumericVector out(N); for (int i = 0; i < N; ++i) { double V = 0; while(V

r random while-loop rcpp 2017-10-11

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使用Rcpp模塊來公開C++類

我想使用Rcpp模塊將C++類暴露給R.我試圖創建一個簡單的例子來理解這是如何工作的。我有兩個Bar和Foo類，它們存儲在它們自己的cpp文件中，位於包的src文件夾中。 Bar.cpp的代碼如下： #include "Bar.h" #include "Foo.h" #include <Rcpp.h> using namespace Rcpp; Bar::Bar(){x = 0;};

c++ r rcpp 2017-10-13

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曖昧超負荷運營商特別是在RCPP

這是一項經修訂問題 在R和RCPP我有一個字符串聲明爲string def; 我也有一個數據幀稱爲Row_Labels包含兩個字母串，「AA」， 「BB」等 現在我試圖做到這一點.. #include <Rcpp.h> #include <string.h> //using namespace Rcpp; //using namespace std; // [[Rcpp::export

r rcpp 2017-10-14

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RCPP功能不能由R

找到我建立一個Rpackage（稱爲myUtils），它使用一個文件cpp，在RStudio以下Hadley's manual。我cpp文件駐留在src目錄，運行後創建：devtools::use_rcpp()，我R目錄下我有一個名爲myUtils.R文件，用這些行： #' myUtils: A package with various functions for my analyses #'

r package rstudio rcpp devtools 2017-12-02

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