[R Mysql的DBCONNECT參數

我正在運行連接到使用包RMySQL一個MySQL數據庫 A R程序，並且一切工作正常。但現在我想要運行同樣的程序低谷RSCRIPT，並想通過連接參數，這樣[R Mysql的DBCONNECT參數

library(RMySQL) 
con_str <- "MySQL(), user = 'root', password = '', dbname = 'nepal_statagri', host = 'localhost'" (this is the string I want to pass as a parameter to RScript) 
mysqlconnection = dbConnect(con_str)

但它不工作，我得到一個消息：

「錯誤（函數（類，FDEF，mtable）：無法找到函數簽名 ' 「字符」'」的繼承的方法 '數據庫連接'

什麼C我呢？

來源

2016-12-07 David Remotti

''RMySQL' dbConnect'沒有可以接受這種格式的單個連接字符串的版本。您將不得不在R腳本中解析輸入字符串，或者使用MySQL組。 –

我已經試過這種方式，但結果是一樣的。或者，也許你可以給一個例子嗎？ –

查看下面@sinQueso給出的答案，您需要修復您的語法或使用組，RMySQL API不會讓您按照您的想法進行操作。 –

如錯誤消息所示，您嘗試通過傳遞一個字符向量來連接到您的數據庫。這是行不通的。

一種選擇是使用正確的語法在你的腳本：

library(RMySQL) 
mysqlconnection <- dbConnect(RMySQL::MySQL(), 
          user = 'root', 
          password = '', 
          dbname = 'nepal_statgri', 
          host = 'localhost')

不過，你提到使用RSCRIPT。所以我的理解是，您有興趣擁有一個不存儲連接細節的R文件，而是希望將這些細節作爲來自shell終端的參數傳遞。

要做到這一點的一個選擇是使用包docopt，它允許您輕鬆地爲您的R腳本創建命令行界面。例如，如果您保存在一個名爲connect_mysql.R下列文件：

'usage: connect_mysql.R [--user <user> --password <pwd> --db <database> --host <host>] 

options: 
    --user username 
    --password password 
    --db database 
    --host host 
' -> doc 

library(docopt) 
library(RMySQL) 

opts <- docopt(doc) 

con <- dbConnect(RMySQL::MySQL(), 
      username = opts$user, 
      password = opts$password, 
      dbname = opts$db, 
      host = opts$host) 
dbListTables(con) 
dbDisconnect(con)

，那麼你就可以把它用RSCRIPT並通過您的連接細節：

Rscript connect_mysql.R --user root --password password --db nepal_statgri --host localhost

來源

2016-12-07 15:32:55 sinQueso

非常感謝你，這正是我需要的！但是....我已經從CRAN下載了DevTools和Docopt兩個軟件包並安裝了它們，但是我無法運行它們，因爲它們需要其他軟件包;我曾經一個接一個地嘗試過，並且記錄了Memoise，Digest，Httr，Withr，R6 ....這似乎是一個永無止境的故事。這裏是我可以獲得所有依賴的地方嗎？ –

'docopt'可從CRAN獲得，並具有最小的依賴關係。如果在R終端輸入'install.packages（「docopt」）'，則所有依賴關係都將被安裝。你不需要'devtools'來安裝它（只有你想從github安裝最新版本）。 – sinQueso

完美！我不知道爲什麼我會按照github的說明操作....非常感謝，對我的工作 –

[R Mysql的DBCONNECT參數

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