Metis - 塊輸出

Question

我正在使用圖形分區API Metis。我有一個來自節點的完整網格，並且想要劃分這個網格。在這個分區之後，一個cfd-solver將在多個gpu上並行運行。問題是：我需要metis的塊輸出（每個維度的節點數相同）。我知道，metis在後臺使用了Graph。

儘管如此，還是有可能獲得塊作爲輸出？

Answer 1

這對你來說可能已經太遲了，但也許對其他人來說也不算太晚。如果你想要一個阻塞的輸出，我也假定你正在使用一個結構化的網格。

如果是這樣，我們可以沿着this answer from SciComp。從METIS創建塊輸出的合理的良好解決方案：

1. 創建一個新圖，該圖封裝了原始問題的塊結構。也就是說，如果我們最初有一個與立方元素相連的50^3立方體的頂點，我們可以通過與立方元素相連的頂點的更小的10^3立方體來「重建」這個結構 。這次除了 ，頂點對應於原始問題的塊。
2. 在新圖上運行METIS。
3. 將結果重新解釋爲METIS的塊輸出，用於解決原始問題 。

我說這是一個「相當不錯」的解決方案，因爲您必須在運行METIS之前自行規定每個維度中的節點數。因此，也許你可以通過某種方式自己優化這個超參數，但也許你只需要進行有根據的猜測並使用METIS提供的輸出來運行。