我想用R來做一些建模,我已經開始使用BodyWeight庫,因爲我已經看到一些在線的例子。只是爲了理解和習慣這些命令。如何繪製通過模型估計R
我來我的最終模型,估計和我不知道如何繪製這些估計,但我還沒有在網上見過..
是否有繪製方式用線估計的值,以及每個觀察值的點數?
從哪裏可以找到關於如何做到這一點的信息,我必須自己提取值還是可以說繪製這些模型的估計值?
我只是以R開頭。任何幫助都是值得歡迎的。
謝謝
我想用R來做一些建模,我已經開始使用BodyWeight庫,因爲我已經看到一些在線的例子。只是爲了理解和習慣這些命令。如何繪製通過模型估計R
我來我的最終模型,估計和我不知道如何繪製這些估計,但我還沒有在網上見過..
是否有繪製方式用線估計的值,以及每個觀察值的點數?
從哪裏可以找到關於如何做到這一點的信息,我必須自己提取值還是可以說繪製這些模型的估計值?
我只是以R開頭。任何幫助都是值得歡迎的。
謝謝
沒有的功能,只是一個繪製模型的輸出,因爲通常有密謀輸出的許多不同的可能途徑。
看看predict
函數適用於您正在使用的任何模型類型(例如,使用lm
具有predict.lm
函數的線性迴歸)。
然後選擇一個繪圖系統(你可能會想要不同的面板爲不同的飲食水平,所以使用ggplot2或格)。然後看看你能否用文字更清楚地描述你想要情節。然後更新你的問題,如果你卡住了。
現在,我們已經確定了哪個數據集使用的是,這裏有一個情節可能:
#Run your model
model <- lme(weight ~ Time + Diet, BodyWeight, ~ 1 | Rat)
summary(model)
#Predict the values
#predict.lme is a pain because you have to specify which rat
#you are interested in, but we don't want that
#manually predicting things instead
times <- seq.int(0, 65, 0.1)
mcf <- model$coefficients$fixed
predicted <-
mcf["(Intercept)"] +
rep.int(mcf["Time"] * times, nlevels(BodyWeight$Diet)) +
rep(c(0, mcf["Diet2"], mcf["Diet3"]), each = length(times))
prediction_data <- data.frame(
weight = predicted,
Time = rep.int(times, nlevels(BodyWeight$Diet)),
Diet = rep(levels(BodyWeight$Diet), each = length(times))
)
#Draw the plot (using ggplot2)
(p <- ggplot(BodyWeight, aes(Time, weight, colour = Diet)) +
geom_point() +
geom_line(data = prediction_data)
)
感謝您的幫助,我剛剛看到這個功能:xyplot(體重〜時間,數據= BodyWeight,groups =飲食,類型= c(「p」,「r」)) 類似於我想要的。這是我第一次嘗試建模 – pavid 2012-04-07 11:42:32
這不是大多數人稱之爲「建模」的東西。這只是顯示數據。 – 2012-04-07 13:51:27
@DWin:可能調用'lme'並不是大多數人所稱的建模。我想他們會去「穿着內衣走上舞臺」。 – 2012-04-07 13:54:43
哪裏'BodyWeight'包?我無法在CRAN或bioconductor上找到它。如果您提供了代碼來重新創建模型,那將會很好。 – 2012-04-07 11:16:20
另外,雖然我很挑剔:a * library *是您安裝* packages *到的文件夾。輸入'.libPaths()'來查看系統上的位置。別擔心,每個人都會對此感到困惑。 – 2012-04-07 11:24:40
對不起,它是庫(nlme)。 BodyWeight包然後,在圖書館nlme。謝謝:) – pavid 2012-04-07 11:40:07