無法理解count.multiple和I​​GRAPH

Question

簡化我與網絡數據R.

library(igraph) 
library(plyr) 

df <- data.frame(sender = c("a", "a", "a", "b", "b", "c","c","d"), 
       receiver = c("b", "b", "b", "c", "a", "d", "d", "a")) 

工作和所遇到的一個奇怪的（或至少我沒想到它）的行爲與 count.multiple在 igraph包

我想要的是統計所有的邊緣，並使用倍數作爲權重。

當我做我的ddply(df, .(sender, receiver), "nrow")結果是：

sender receiver nrow 
1  a  b 3 
2  b  a 1 
3  b  c 1 
4  c  d 2 
5  d  a 1 

這是我期望的那樣。

但是，我不能重現此使用的igraph的count.multiple，這是我預料到的igraph

df.graph <- graph.edgelist(as.matrix(df)) 
E(df.graph)$weight <- count.multiple(df.graph) 

E(df.graph)$weight內做到這一點產生：

3 3 3 1 1 2 2 1 

然後我用了simplify命令：

df.graph <- simplify(df.graph) 

其中pr oduces

9 1 1 4 1 

我得到的是什麼回事，簡化只是在添加權重，但我不明白爲什麼/時，這將被用來作爲反對什麼，ddply是做..？

有什麼想法？

謝謝！

Answer 1

simplify的默認行爲是添加多條邊的權重。

爲了避免重複計算，你可以設置初始權重爲1

g <- graph.edgelist(as.matrix(df)) 
E(g)$weight <- 1 
g <- simplify(g) 
E(g)$weight 

或改變他們聚集的方式。

g <- graph.edgelist(as.matrix(df)) 
E(g)$weight <- count.multiple(g) 
g <- simplify(g, edge.attr.comb = list(weight=max, name="concat", "ignore")) 
E(g)$weight