knitr繪圖代碼塊被看到和運行

Question

我一直在嘗試使用knitr解決以下問題。 在\LaTeX我希望定義一個名爲myplot的塊（一次）。 然後我想說的東西如：Figure~\ref{fig:myownlabel}

代碼

<<myplot, tidy = FALSE>>= 
plot(runif(9), runif(9), 
    xlab = "x", 
    ylab = "y",) 
@ 

結果。

\begin{figure}[hh] 
\begin{center} 
<<myplotfig, out.width='.50\\linewidth', width=6.6, height=4.8, echo=FALSE>>= 
par(las = 1, mfrow = c(1, 1), mar = c(5, 4, 1, 1)+0.1) 
<<myplot>> 
@ 
\caption{ 
I insist to have the caption in \LaTeX. 
\label{fig:myownlabel} 
} 
\end{center} 
\end{figure} 

我知道如何做到這一點的Sweave，但似乎無法做到這一點的knitr。 也就是說，代碼塊被讀者看到。 你能給我什麼建議嗎？ 在此先感謝。 托馬斯

Answer 1

這是knitr和Sweave之間的一個區別：Sweave默認情況下不保持地塊（除非你指定fig=TRUE），但knitr做（除非你真的不想讓他們使用fig.keep='none'）。

<<myplot, tidy = FALSE, fig.keep = 'none'>>= 
plot(runif(9), runif(9), 
    xlab = "x", 
    ylab = "y",) 
@ 

\begin{figure}[hh] 
\begin{center} 
<<myplotfig, out.width='.50\\linewidth', fig.width=6.6, fig.height=4.8, echo=FALSE>>= 
par(las = 1, mfrow = c(1, 1), mar = c(5, 4, 1, 1)+0.1) 
<<myplot>> 
@ 
\caption{ 
I insist to have the caption in \LaTeX. 
\label{fig:myownlabel} 
} 
\end{center} 
\end{figure} 

雖然問題迄今已解決了，我有一些其他意見：

1. 當您使用knitr（>= 1.1），你應該能夠看到有關的語法警告你代碼塊，並且您需要致電Sweave2knitr()來解決問題;您將意識到width和height在knitr（使用fig.width和fig.height）中不是有效的塊選項;見here for more information
2. 爲塊myplot，我會使用eval=FALSE，因爲你可能不想兩次評估代碼;

3. 與knitr，你實際上可以通過塊選項來做所有事情，例如，

   <<myplot, tidy=FALSE, eval=FALSE, echo=-1>>= 
   @ 
   <<myplot, out.width='.5\\linewidth', fig.width=6.6, fig.height=4.8, fig.align='center', echo=FALSE, fig.pos='hh', fig.cap='I insist to have the caption in \\LaTeX.'>>= 
   par(las = 1, mfrow = c(1, 1), mar = c(5, 4, 1, 1)+0.1) 
   plot(runif(9), runif(9), 
       xlab = "x", 
       ylab = "y",) 
   @ 
   

   這給你們倆center和figure環境，並自動生成一個標籤fig:myplot。