2016-03-04 67 views
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我已經使用了一個特殊的物種分佈建模程序來創建100個生態位寬度的估計。這裏最重要的部分是數據被輸入到R.計算R中的Bootstrap置信區間和來自另一個程序的點估計

有了這些生態位寬度估計之前產生的,我想避開的平均生態位寬度值的置信區間。

我所見過的引導和bootobject功能,但在我看來,你是生成使用功能,這是沒有必要的自舉值,我想。

請分享有關獲取此數據配置項的任何建議。

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'位數(niche_estimates,C(0.025,0.975))'? –

回答

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這可能是一個關於統計而不是編程的問題。但是引人注意的是,引導配置項需要從數據中提取自舉重採樣,並從重採樣中重新估算您感興趣的數量,然後檢查重採樣之間的估計分佈。那麼從R到你的物種計劃如何去另一種方式呢?在R中生成resamples,並在其他程序中迭代它們。

凡從你的數據重新取樣,也許:

d = cars 
resamples = lapply(1:1000, function(b) { 
    d_resample = d[sample(1:nrow(d), nrow(d), replace = TRUE), ] 
    d_resample$boot = b 
    d_resample 
}) 

stacked = dplyr::bind_rows(resamples) 

然後通過在其他程序啓動變量子集。