合併具有相似ID和總和對應值的行

Question

我想合併相似的行以創建一個唯一的輸出矩陣，它將-符號之後的計數相加。請參閱我下面的例子：

278-3192 NC_002188.1 
310-2831 NC_007653.1 
384-2206 NC_004068.1 
1059-573 NC_004068.1 

輸出

NC_002188.1 3192 
NC_007653.1 2831 
NC_004068.1 2779 

Answer 1

您可以使用awk的關聯數組：

awk '{split($1,a, "-"); arr[$2]+=a[2]} END{for(i in arr) print i, arr[i]}' file 

Answer 2

如果記錄已經由NC_xxxx數字排序，你可以不用數組（您也可以在使用前對文件進行排序sort）：

awk -F'[- ]' 'o!=$3{print o,s;o=$3;s=$2;next}{s+=$2}END{print o,s}' file