在bash中由awk創建的索引變量

我在用awk從一個文本文件中導出一個變量（由包含4行的1行組成的索引）時遇到了一些麻煩。在bash中由awk創建的索引變量

特別是，我有一個文本文件包含循環的所有輸入信息。每行包含4個特定的輸入值，並且每次迭代都使用輸入文件的不同行。

輸入文件是這樣的：

/home/hannelore/TVB-pipe_local/subjects/CON02T1/ 10012 100000 1001 --> used for iteration 1 
/home/hannelore/TVB-pipe_local/subjects/CON02T1/ 10013 7200 1001 --> used for iteration 2 
...

從這個輸入的文本文件，我確定了不同的列（路徑，種子，計數，目標），然後我就想指標，這些變量在每次迭代循環。但是，索引0返回整個變量，而較高的索引返回而不輸出。在這個獲得的變量上使用awk，cut或IFS，我無法分割變量。誰能幫我這個？

，我使用的一些代碼：

seed=$(awk '{print $2}' $input_file)

- 從輸入文件>提取塔的信息，這個工作

seedsplit=$(awk '{print $2}' $seed) 

seedsplit=$(cut -f2 -d ' ' $seed)"

預先感謝您！

親切的問候，

謝漢內洛爾·

來源

2015-10-29 Hannelore Aerts

我不明白你在'seedsplit'任務中做了什麼。 awk的第二個參數是文件名，但是'$ seed'包含輸入文件的第2個字段的所有值。 – Barmar

沒有足夠的信息。這些路徑位置有哪些文件？它們包含什麼，你想從中提取什麼？ –

你想索引什麼變量？我在代碼中看不到任何數組。 – Barmar

如果我理解正確的話，你想按行提取輸入文件行的值。

while read a b c d; do echo "var1:" ${a}; done < file

將打印

var1: /home/hannelore/TVB-pipe_local/subjects/CON02T1/ 
var1: /home/hannelore/TVB-pipe_local/subjects/CON02T1/

同樣可以訪問B，c和d的其他變量。

來源

2015-10-29 19:48:41 karakfa

如果你想要一個數組，然後使用數組賦值表示：

seed=($(awk '{print $2}' $input_file))

現在，你將在一個單獨的數組元素具有輸出的每一行字從awk。

col1=($(awk '{print $1}' $input_file)) 
col3=($(awk '{print $3}' $input_file))

現在你有三個可以並行索引的數組。

for i in $(seq 1 "${#col1[@]}" 
do 
    echo "${col1[$i]} in col1; ${seed[$i]} in col2; ${col3[$i]} in col3" 
done

來源

2015-10-29 19:54:34

在bash中由awk創建的索引變量

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