使用Scipy Kmeans的熊貓數據框的子集？

我有一個數據框，我使用df = pd.read_csv('my.csv',sep=',')導入。在該CSV文件中，第一行是列名稱，第一列是觀察名稱。使用Scipy Kmeans的熊貓數據框的子集？

我知道如何選擇熊貓數據框的子集，使用：

df.iloc[:,1::]

這給我的只有數值。但是，當我嘗試使用這個使用這個命令scipy.cluster.vq.kmeans，

kmeans(df.iloc[:,1::],3)

我得到的錯誤'DataFrame' object has no attribute 'dtype'

有什麼建議？

來源

2015-06-22 user1566200

你不能只選擇第一列並通過這個？像kmeans（df。[df.columns [0]]，3）' – EdChum

我想運行使用除第一列之外的所有列的kmeans（因爲第一列填滿了字符串）。 – user1566200

well'kmeans（df。[df.columns [1：]]，3）'那是 – EdChum

這是一個使用KMeans的例子。

from sklearn.datasets import make_blobs 
from itertools import product 
import numpy as np 
import pandas as pd 
from sklearn.cluster import KMeans 

# try to simulate your data 
# ===================================================== 
X, y = make_blobs(n_samples=1000, n_features=10, centers=3) 

columns = ['feature' + str(x) for x in np.arange(1, 11, 1)] 
d = {key: values for key, values in zip(columns, X.T)} 
d['label'] = y 
data = pd.DataFrame(d) 

Out[72]: 
    feature1 feature10 feature2 ... feature8 feature9 label 
0  1.2324 -2.6588 -7.2679 ...  5.4166 8.9043  2 
1  0.3569 -1.6880 -5.7671 ...  -2.2465 -1.7048  0 
2  1.0177 -1.7145 -5.8591 ...  -0.5755 -0.6969  0 
3  1.5735 -0.0597 -4.9009 ...  0.3235 -0.2400  0 
4  -0.1042 -1.6703 -4.0541 ...  0.4456 -1.0406  0 
..  ...  ...  ... ...   ...  ... ... 
995 -0.0983 -1.4569 -3.5179 ...  -0.3164 -0.6685  0 
996 1.3151 -3.3253 -7.0984 ...  3.7563 8.4052  2 
997 -0.9177  0.7446 -4.8527 ...  -2.3793 -0.4038  0 
998 2.0385 -3.9001 -7.7472 ...  5.2290 9.2281  2 
999 3.9357 -7.2564 5.7881 ...  1.2288 -2.2305  1 

[1000 rows x 11 columns] 

# fit your data with KMeans 
# ===================================================== 

kmeans = KMeans(n_clusters=3) 
kmeans.fit_predict(data.ix[:, :-1].values) 

Out[70]: array([1, 0, 0, ..., 0, 1, 2], dtype=int32)

來源

2015-06-22 15:51:02

make_blobs的用途是什麼？也許我不太瞭解Kmeans，但在Matlab中，您可以簡單地輸入一個矩陣，其中行是觀察值，列是您希望用於聚類分析的不同變量，以及您想要的羣集數量吐出一個索引數組，將每個觀察值分配給三個聚類中的一個。 – user1566200

它只是生成一些人造聚類數據。在這裏，我嘗試使用1000個obs來模擬一個樣本，其中每個obs都有10個特徵。總共有3個集羣中心。 –

啊，我明白了，謝謝。我會嘗試這種方法。 – user1566200

使用Scipy Kmeans的熊貓數據框的子集？

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