製作堆疊barplot作爲註釋時只有一個條塊

我想要在熱圖上將一個堆疊barplot作爲列註釋。我使用ComplexHeatmap。製作堆疊barplot作爲註釋時只有一個條塊

這是barplot輸入（富）：

 V1 V2 V3 
1 28.50 67.30 0.00 
2 0.00 63.90 25.40 
3 16.30 67.80 15.90 
4 24.10 75.30 0.00 
5 0.00 70.90 20.60 
6 18.90 62.50 13.90 
7 19.80 68.70 11.50 
8 22.60 64.90 10.10 
9 28.10 66.80 0.00 
10 16.60 74.30 0.08 
11 0.14 79.90 0.06 
12 23.70 0.71 0.00 
13 26.70 66.60 0.00 
14 16.80 58.20 20.60 
15 13.30 82.20 0.00 
16 0.32 61.70 6.30 
17 21.50 62.20 0.14

爲簡單起見，我已刪除了其他註釋和熱圖，只是使「麻煩」註釋情節。這是我的代碼：

library(ComplexHeatmap) 
ha = HeatmapAnnotation(barplot = anno_barplot(foo), annotation_height = unit(30,"mm")) 
hm = Heatmap(zero_row_mat, top_annotation = ha) 
hm

而且這是所得到的barplot

讀ComplexHeatmap參考手冊，我本來期望的堆疊barplot因爲我的輸入是一個matrix（超過1個柱），但是我只能得到一個酒吧。我無法弄清楚我做錯了什麼。有任何想法嗎？

來源

2017-06-16 Helga Bergholtz

你說的沒錯，當我運行：

DF <- data.frame(A = rep(c(0,5), 5), B = 2:11, C = 3:12) 
hb = HeatmapAnnotation(barplot = anno_barplot(DF), annotation_height = unit(30,"mm")) 
hm = Heatmap(matrix(1:10,nrow=1), top_annotation = hb) 
hm

我得到一個堆疊barplot。你得到了什麼？

來源

2017-06-16 21:00:14 CPak

我仍然沒有得到一個堆疊的barplot，只有一個酒吧。（http://imgur.com/5klhhyi） –

不確定。我想，先更新所有的軟件包。那麼，你可以嘗試使用'DF'在基本R中製作一個堆疊的barplot嗎？ – CPak

製作堆疊barplot作爲註釋時只有一個條塊

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