R不追加行文件（使用目錄或寫）

我試圖從計算器一些選項（例如1），但這也好好嘗試一下工作，所以也許有在我的代碼錯誤：
R不追加行文件（使用目錄或寫）

fileConn<-file("outputR.txt") 
for (i in 1:length(lines)){ 
    line = lines[i] 
    fields = strsplit(line, "\t")[[1]] 
    id = fields[1] 
    goIDs = fields[2:length(fields)] 
    list = as.list(GOCCANCESTOR[goIDs]) 
    text = paste(toString(id), ":", toString(goIDs)) 
    cat(text, file=fileConn, append=TRUE, sep = "\n") 

} 
close(fileConn)

當我運行這段代碼時，它會一直覆蓋outputR.txt文件中的數據。任何建議來解決這個問題？

來源

2016-10-09 Bioinformatician

您可以找到[這裏]（HTTP答案：//堆棧overflow.com/questions/17710469/why-wont-cat-append-to-a-file-connection?rq=1）文章。 – dertomtom

的問題是，你是在組合使用帶的FileConnection然後cat追加將無法正常工作。還有，你可以使用幾個選項，最簡單的一個是這樣的：
第一「創造」的文件，如果你想添加一個標題，例如：

header = "some header" 
## if you don't want to use a header then leave the header blank 
header ="" 
cat(text, file="outputR.txt", append=FALSE, sep = "\n")

通知append = FALSE這是必要的，如果要清除的文件，如果它已經存在，否則，您必須使用append = TRUE
的，你可以使用文本寫入它：

text = text = paste(toString(id), ":", toString(goIDs)) 
cat(text file="outputR.txt", append=TRUE, sep = "\n")

來源

2016-10-09 13:02:09

謝謝！ @Rick Beeloo，您忘記將第二個代碼示例中的標題更改爲文本，但很明顯 – Bioinformatician

對不起，我編輯了我的答案！ –

由於幫助頁面貓態：

追加：邏輯。僅在參數文件是文件的名稱（而不是連接或「| cmd」）時才使用。如果TRUE輸出將被附加到文件;否則，它會覆蓋文件的內容。

因此，如果在文件參數中使用連接，append參數的值將被忽略。

只需指定文件參數作爲文件名：

cat(text, file="outputR.txt", append=TRUE, sep = "\n")

來源

2016-10-09 10:13:01 wiep

使用cat時是否需要關閉文件？ @wiep – Bioinformatician

如果你已經用''''''''函數打開了這個文件，那麼你必須關閉連接。如果你在'''cat'''函數中使用了文件名，cat會爲你處理這個。見源https://github.com/wch/r-source/blob/trunk/src/library/base/R/cat.R – wiep

你這裏有兩種選擇：

1. 以寫模式打開文件：

lines <- c("aaaaa", "bbbb") 


fileConn<-file("test.txt", "w") 
for (i in 1:length(lines)){ 
    line = lines[i] 
    cat(line, file=fileConn, append=TRUE, sep = "\n") 
} 
close(fileConn)

使用寫入功能與append參數：

lines <- c("aaaaa", "bbbb") 

for (i in 1:length(lines)){ 
    line = lines[i] 
    write(line,file="test2",append=TRUE) 
}

來源

2016-10-09 10:44:16

我已經嘗試了第二個，這給了我同樣的問題（覆蓋） – Bioinformatician

這很奇怪。 fileConn <-file（「test.txt」，「w」）不起作用？您應該發佈整個數據，包括行數變量。 –

R不追加行文件（使用目錄或寫）

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