tcsh錯誤：while循環

Question

這是一個基本的程序，但由於我是一個新手，我無法找出解決方案。

我有一個名爲rama.xvg以下列格式的文件：

-75.635 105.879 ASN-2 
-153.704 64.7089 ARG-3 
-148.238 -47.6076 GLN-4 
-63.2568 -8.05441 LEU-5 
-97.8149 -7.34302 GLU-6 
-119.276 8.99017 ARG-7 
-144.198 -103.917 SER-8 
-65.4354 -10.3962 GLY-9 
-60.6926 12.424 ARG-10 
-159.797 -0.551989 PHE-11 
65.9924 -48.8993 GLY-12 
179.677 -7.93138 GLY-13 
.......... 
........... 
-70.5046 38.0408 GLY-146 
-155.876 153.746 TRP-147 
-132.355 151.023 GLY-148 
-66.2679 167.798 ASN-2 
-151.342 -33.0647 ARG-3 
-146.483 41.3483 GLN-4 
.......... 
.......... 
-108.566 0.0212432 SER-139 
47.6854 33.6991 MET-140 
47.9466 40.1073 ASP-141 
46.4783 48.5301 SER-142 
-139.17 172.486 LYS-143 
    58.9514 32.0602 SER-144 
    60.744 18.3059 SER-145 
-94.0533 165.745 GLY-146 
-161.809 177.435 TRP-147 
129.172 -101.736 GLY-148 

我需要提取包含「ASN-2」在一個文件中all_1.dat等所有147的所有行殘留物。

如果我在終端運行下面​​的命令，它給出了ASN-2所需的輸出：

awk '{if(NR%147 == 1) printf $0 "\n"}' rama.xvg > all_1.dat 

爲了避免反覆做它的所有殘基，我已經寫下面的代碼。

#!/bin/tcsh 
set i = 1 
    while ($i < 148) 
    echo $i 
    awk '{if(NR%147 == i) printf $0 "\n"}' rama.xvg > all_"$i".dat 
    @ i++ 

end 

但是這段代碼在所有輸出文件中打印出包含GLY-148的行。

請讓我知道這段代碼中的錯誤是什麼。我認爲這與嵌套有關。

Answer 1

在你的awk -line變量i是一個awk變量不是shell變量！如果你想使用shell變量$i你可以這樣做：

awk -v i="$i" '{if(NR%147 == i) printf $0 "\n"}' rama.xvg > all_"$i".dat 

但我覺得會更好地把你的while -loop到awk：

awk '{for (i=1; i<=147; i++) { if (NR%147==i) {printf $0 "\n" > ("all_" i ".dat") } } }' rama.xvg