1
我試圖做一個堆疊的條形圖,X軸是時間,Y軸是金額,填充顏色是某些功能。ggplot堆積條形圖的x值和沒有y /填充值
我的數據看起來是這樣的:
> base
Number Mut Time Percent
1 117 22:A->G 2 81.81
2 13 24:G->A 2 9.09
3 10 22:A->G 24:G->A 108:G->A 158:G->A 162:G->A 2 6.99
4 1 22:A->G 24:G->A 2 0.69
5 32 24:G->A 3 94.11
6 1 24:G->A 162:G->T 3 2.94
7 1 24:G->A 82:G->T 3 2.94
當我使用的代碼做一個堆積條形圖中ggplot:
ggplot(base,aes(x = Time, fill = Mut, y = Percent)) + geom_bar(stat='identity') + theme(legend.key.size = unit(.5, "cm")) + ylab("Number")
我得到類似如下的圖表:
http://imgur.com/32XCkTm,yfCAJsx#0
我的問題是我想那裏有零值fo R個時間= 1和時間= 4
事情與此類似:
http://imgur.com/32XCkTm,yfCAJsx#1
有沒有一種方法,我可以做到這一點?現在,我只是說0值數據爲時間1和4,並加入我的填充功能(MUT)是一個已經在數據出現了:
> base
Reads Mut Time Percent
1 0 22:A->G 1 0.00
2 117 22:A->G 2 81.81
3 13 24:G->A 2 9.09
4 10 22:A->G 24:G->A 108:G->A 158:G->A 162:G->A 2 6.99
5 1 22:A->G 24:G->A 2 0.69
6 32 24:G->A 3 94.11
7 1 24:G->A 162:G->T 3 2.94
8 1 24:G->A 82:G->T 3 2.94
9 0 22:A->G 4 0.00
我的問題是我不希望有繼續搜索已經在數據中的特徵(Mut)。有沒有一種方法可以讓ggplot自動將時間= 1和時間= 4的x值放入沒有條形圖的圖形中,而無需向數據添加值?我一直在尋找幾個小時,找不到任何答案。
謝謝。
只是讓 「時間」 的一個因素。 'base $ Time < - factor(base $ Time,levels = 1:4)'。這樣'ggplot'將會「知道」關於缺失的值。 – MrFlick
這工作得很好,謝謝! –