如何使用grepl函數的變量的內環路-R

我是新來的R和，有一些問題的循環和grepl功能我有類似的數據：如何使用grepl函數的變量的內環路-R

str(peptidesFilter) 
    'data.frame': 78389 obs. of 130 variables: 
$ Sequence      : chr "AAAAAIGGR" "AAAAAIGGRPNYYGNEGGR" "AAAAASSNPGGGPEMVR" "AAAAAVGGR" ... 
$ First.amino.acid    : chr "A" "A" "A" "A" ... 
$ Protein.group.IDs    : chr "1" "1;2;4" "2;5 "3" "4;80" ...

我想過濾使用下面

peptidesFilter.new <- peptidesFilter[grepl('(^|;)2($|;)', 
peptidesFilter$Protein.group.IDs),]

grepl函數的數據根據$ Protein.group.IDs我想與每一個人的數據的循環（如1，2，3，等...）並重新做 - 包含變量肽的數據幀的名稱FilterFilter.i

i =1 
    while(i <= N) { peptidesFilter.[[i]] <- 
    peptidesFilter[grepl('(^|;)i($|;)', 
    peptidesFilter$Protein.group.IDs),] 
    i=i+1 }

我有兩個問題，最主要的一個我在grep1功能不承認爲一個變量，我怎麼能重新命名的方式，將包含變量過濾後的數據。

有什麼想法？

來源

2013-05-21 Samir

對於grepl問題，您可以使用paste0例如：

paste0('(^|;)',i,'($|;)')

對於循環，可以使這樣的事情：

ll <- lapply(seq(1:4),function(x) 
     peptidesFilter[grepl(paste0('(^|;)',x,'($|;)'), 
          peptidesFilter$Protein.group.IDs),])

，那麼你可以將其轉換爲data.frame：

do.call(rbind,ll) 

      Sequence First.amino.acid Protein.group.IDs 
1   AAAAAIGGR    A     1 
2 AAAAAIGGRPNYYGNEGGR    A    1;2;4 
21 AAAAAIGGRPNYYGNEGGR    A    1;2;4 
3 AAAAASSNPGGGPEMVR    A    2;5 
4   AAAAAVGGR    A     3 
22 AAAAAIGGRPNYYGNEGGR    A    1;2;4

來源

2013-05-21 13:48:50 agstudy

非常感謝！ paste0（'（^ |;）'，i，'（$ |;）'）解決了grep1問題，我無法理解lapply，基本上我想根據ID拆分數據，然後進一步處理每個拆分的數據。例如序列信息。 do.call（rbind，ll），它再次合併所有數據。是否有可能創建單獨的數據框（如peptideFilterx1，peptidesFilterx2等），當x = 1，x = 2等...或者我理解你錯了嗎？ – Samir

@Samir列表ll是你想要的，我想。 – agstudy

對不起，我現在想通了。非常感謝 – Samir

如何使用grepl函數的變量的內環路-R

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