2014-01-12 63 views
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執行重複測量方差分析的通用代碼是什麼?重複測量方差分析

我目前使用的代碼:

summary(aov(Chlo~Site,data=alldata)). 

有三種不同的網站(網站)和我單獨測試(氯仿溶劑,SST,DAC和PAR)四個expirmental變量。我也評估這些變數和年份(2003年至2012年)之間的差異:

summary(aov(Chlo~Year,data=year)) 

任何幫助將不勝感激!

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請閱讀可用,以便指導有關提交「偉大的可重複的例子」。目前這看起來像一個關於重複措施的個性化教程的請求,並且您沒有顯示搜索SO或任何其他資源的證據。 –

回答

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一般而言,您應避免使用aov執行多個調用,而應使用混合效應線性模型。

你可以找到在這個post by Paul Gribble

我經常使用的nlme包幾個例子,如:

require(nlme) 
model <- lme(dv ~ myfactor, random = ~1|subject/myfactor, data=mydata) 

根據不同的情況下,你可以運行更復雜的情況,我建議有看Julian Faraway的非常清晰的書「用R擴展線性模型:廣義線性,混合效應和非參數迴歸模型」

另外,如果您有更具體的統計問題,您可能需要詢問CrossValidated

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爲什麼你推薦GLM?隨後顯示一個線性混合效應模型。我還建議閱讀[Zuur等人](http://www.springer.com/life+sciences/ecology/book/978-0-387-87457-9),因爲它通過實際例子給出了一個簡單的介紹。 (他們已經向CV提出過要求,但看起來他們迫切需要在本週末解決這個問題。) – Roland

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@Roland:對不起,我確實是指混合效應模型,感謝您發現這個問題,我已經糾正了它。 – nico

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在這種情況下,我是否正確地說: model <-lme(Chlo〜Site,random =〜1 | subject/Site,data = mydata)? 此代碼中的主體代表什麼? – user3170629

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使用aov函數的技巧就是您只需要添加Error項。正如guides之一所說:「錯誤」一詞必須反映出我們有「在主體內嵌套治療」。

所以,你的情況,如果Site是重複測量,你應該使用:

summary(aov(Chlo ~ Site + Error(subject/Site), data=alldata)) 
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'主題'是特定於重複還是主題設計?如果是,它是否有代表這兩點的代碼?我輸入了上述函數,並收到響應:找不到對象'Subject' – user3170629