Plotly as png in knitr/rmarkdown

以下Rmarkdown以HTML形式繪製三維圖形，但不以PDF形式繪製。Plotly as png in knitr/rmarkdown

Testing plotly 

```{r} 
library(plotly) 
p <- plot_ly(data=iris, x=~Sepal.Length, y=~Sepal.Width, z=~Petal.Length, 
      color=~Species, symbols=c(0,1), type="scatter3d", mode="markers") 
p 
```

曲線圖的快照顯示如下：

按照plotly help page：

如果使用rmarkdown與HTML輸出，打印plotly對象在代碼塊將導致交互式HTML圖形。 當使用非HTML輸出的rmarkdown時，打印一個陰謀對象會導致圖形的PNG截圖。

有沒有辦法在PDF中渲染繪圖圖形？

注：從rmarkdown::render()的錯誤是：

來源

2016-10-26 Megatron

我已經創建了一個小的解決辦法，它保存在本地plotly圖像爲PNG文件和進口它回到RMD文件。您需要的包webshot，可將其加載通過：

更進一步，你需要通過

webshot::install_phantomjs()

然後安裝phantomjs（當phantomjs在PATH），你可以創建你RMD文件：

--- 
title: "Untitled" 
output: pdf_document 
--- 

```{r} 
library(plotly) 
p <- plot_ly(economics, x = ~date, y = ~unemploy/pop) 

tmpFile <- tempfile(fileext = ".png") 
export(p, file = tmpFile) 
``` 
![Caption for the picture.](`r tmpFile`)

這對我有用..也許這也是你的解決方法！

來源

2016-10-26 17:59:00

我目前正在做同樣的事情，但得到的圖像中間有一個很大的文本錯誤：「WebGL不支持您的瀏覽器 - ...」。任何想法如何解決這個問題？ – Megatron

我應該澄清 - 我試圖從3D散點圖中生成PNG時出現WebGL錯誤（未在我的問題中顯示） – Megatron

還有我的小例子，這不正常嗎？ –

由於@hrbrmstr評論，export()以前根本不支持WebGL，但更新的版本支持通過RSelenium導出到PNG（請參閱help(export, package = "plotly")）。如果您需要pdf導出，您必須爲雲帳戶付款 - https://plot.ly/products/cloud/

來源

2017-03-08 23:41:34 Carson

似乎目前在GitHub（目前爲4.5.6.9000）中的開發版尚未準備好，因爲運行export（）只會產生一個空白圖像。 – Megatron

與R markdown compile error:相同的問題。你需要選擇你想要的格式，試着看看我的。

--- 
title: "<img src='www/binary-logo.jpg' width='240'>" 
subtitle: "[<span style='color:blue'>binary.com</span>](https://github.com/englianhu/binary.com-interview-question) Interview Question I" 
author: "[<span style='color:blue'>®γσ, Lian Hu</span>](https://englianhu.github.io/) <img src='www/ENG.jpg' width='24'> <img src='www/RYO.jpg' width='24'>白戸則道®" 
date: "`r Sys.Date()`" 
output: 
    tufte::tufte_html: 
    toc: yes 
    tufte::tufte_handout: 
    citation_package: natbib 
    latex_engine: xelatex 
    tufte::tufte_book: 
    citation_package: natbib 
    latex_engine: xelatex 
link-citations: yes 
---

來源

2017-09-13 12:04:37

我做什麼，這樣渲染PDF的工作，但你仍然可以在其他針織類型和作爲R工作室rmarkdown文件的互動情節是：

這正好在安裝塊（或真的，此文件中上旬）：

is_pdf <- try (("pdf_document" %in% rmarkdown::all_output_formats(knitr::current_input())), silent=TRUE) 
is_pdf <- (is_pdf == TRUE)

那麼這種使用基於你是什麼樣的文件CRE渲染任何plotly情節ating：

if (is_pdf) { export(base_plot) } else {base_plot}

在該示例中base_plot是該圖的名稱。

來源

2018-03-05 05:52:38

Plotly as png in knitr/rmarkdown

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