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我有一個文件「的abc.txt」具有以下內容開頭的字..顯示線在一個文件中的Python正則表達式
EMBOSS_001 601 FEDSESRRDSLFVPHRPGERRNSNGTTTETEVRKRRLSSYQISMEMLEDS 650
:...::.||...||....|..|.|.... |..:.|.|.|..:
EMBOSS_002 1 -----NPSLTVTVPIAVGESDFENLNTEEFSSE----SELEESKEKLNAT 41
EMBOSS_001 651 SGRQRS-MSIASILTNTMEELE-ESRQKCPPCW-------YRFANVFLIW 691
|..:.| :.:|........|:| |...|...|: :.|..|....
EMBOSS_002 42 SSSEGSTVDVAPPREGEQAEIEPEEDLKPEACFTEGCIKKFPFCQVSTEE 91
我想創建三個字符串.. 第一個「一」應該有EMBOSS_001後，多數民衆贊成編寫的所有字符（包括該行），即
A="FEDSESRRDSLFVPHRPGERRNSNGTTTETEVRKRRLSSYQISMEMLEDSSGRQRS-MSIASILTNTMEELE-ESRQKCPPCW-------YRFANVFLIW"
第二個字符串應該EMBOSS_002後所擁有的一切書面（包括線條的）減去數，即
B="-----NPSLTVTVPIAVGESDFENLNTEEFSSE----SELEESKEKLNATSSSEGSTVDVAPPREGEQAEIEPEEDLKPEACFTEGCIKKFPFCQVSTEE"
和第三串C應該不管是EMBOSS_1和EMBOSS_2（字母數字字符或 - ）之間在兩個線
C=" :...::.||...||....|..|.|.... |..:.|.|.|..|..:.| :.:|........|:| |...|...|: :.|..|...."
原始空間在開始，結束（如果有的話），並在中間C應該是完好的。在這種情況下，5位是在一開始，因爲C來自A的「F」，並開始「 - 」說明B
感謝
stackoverflow不寫你的代碼給你。但是，它會幫助您解決編寫代碼時遇到的問題。這個問題很快就會被解決爲「不是問題」;請參閱http://stackoverflow.com/faq – msw
不幸的是，這個問題已被標記爲關閉，所以這是一個評論，而不是一個答案。您正在嘗試閱讀EMBOSS成對對齊格式，因此最簡單的答案是安裝Biopython並使用格式名稱爲「emboss」的Bio.AlignIO。請參閱http://emboss.sourceforge.net/docs/themes/alnformats/align.pair和http://www.biopython.org/wiki/AlignIO – peterjc