素食主義者包cca錯誤：rowsum（X）必須> 0：缺少值，其中TRUE/FALSE需要

Question

我想運行規範對飲食組成數據（prey.counts）對應一套環境變量（ENVVAR）。每一行和每一列總和大於0，但我不斷收到此錯誤信息：

diet <- cca(prey.counts, envvar$SL + envvar$Month + envvar$water.temp + 
      envvar$salinity + envvar$DO) 

Error in if (any(rowSums(X) <= 0)) stop("All row sums must be >0 in the community data matrix") : 
    missing value where TRUE/FALSE needed 

我已經雙重和三重檢查NAS或空列/行prey.counts數據幀，沒有他們的總和爲零或缺少值。 R，RStudio和所有軟件包都是最新的。任何幫助，將不勝感激！

梅雷迪思

Answer 1

的問題是你如何調用該函數，你似乎是混合的默認和配方接口（和，而你在它濫用公式符號）。

這是否幫助：

diet <- cca(prey.counts ~ SL + Month + water.temp + salinity + DO, data = envvar) 

另外，如果命名變量是唯一在envvar，你可以做任何的

diet <- cca(prey.counts ~ ., data = envvar) 

或

diet <- cca(prey.counts, envvar) 

與後者使用靈活性較低但簡單的default方法用於cca()。