如何在Rcpp代碼中創建R包的S4類的實例

我正在用Rcpp試圖從Rcpp代碼中創建sparseMatrix的實例，讓自己的腳變得溼潤。如何在Rcpp代碼中創建R包的S4類的實例

據我所知，爲了創造S4對象我們稱之爲S4的構造與所需類的名字作爲一個字符串，如：

S4 foo() { 
    S4 s("dgCMatrix"); 
    return s; 
}

但在我的情況下，這將失敗，並

Error in getClass("dgCMatrix") : 「dgCMatrix」 is not a defined class

我認爲這是因爲Matrix包尚未加載？我曾嘗試添加

// [[Rcpp::depends(Matrix)]]

以及包的描述中的Matrix的Imports和LinkingTo指令，但我仍然得到相同的錯誤。如何從Rcpp中創建來自R類的實例？

UPDATE：以下coatless'answer，類需要在命名空間被導入，如果Matrix是不被加載：

//' @importClassesFrom Matrix dgCMatrix 
// [[Rcpp::export]] 
S4 foo() { 
    S4 s("dgCMatrix"); 
    return s; 
}

的情況下，照顧它使用的是Roxygen2管理的命名空間。

來源

2017-06-15 gorgonzola

咦？這個表達式應該表示什麼：'S4 s（「dgCMatrix」）'......需要更多的代碼。 –

您不要在那裏調用構造函數'Matrix'。要麼從Rcpp調用這個R函數，要麼在C++中創建自己的構造函數。或者使用Armadillo的稀疏矩陣類。 – Roland

在[Rcpp Gallerty]（http://gallery.rcpp.org）上有_e.g._的例子。 –

您遇到的問題是尚未加載的Matrix軟件包。因此，當Rcpp搜索dgCMatrix ctor時，它會顯示爲空，從而觸發您看到的錯誤。爲了解決這個問題，您可以簡單地在每個會話開始時加載一次Matrix庫。例如

library("Matrix") 
sourceCpp("path/to/S4_declaration.cpp")

或者，你可以添加在sourceCpp編譯要執行負載調用。這是更加極端的，因爲你只需要加載一次庫。

雖然，下面要經常下sourceCpp()

#include <Rcpp.h> 

// [[Rcpp::export]] 
Rcpp::S4 make_dgCMatrix() { 
    Rcpp::S4 s("dgCMatrix"); 
    return s; 
} 


/*** R 
library("Matrix") 
make_dgCMatrix() 
*/

工作，當你把這個成R包，請確保您導入Matrix包在DESCRIPTION

Imports: 
    Matrix

並導入dgCMatrix定義在NAMESPACE。

importClassesFrom(Matrix, dgCMatrix)

來源

2017-06-15 16:19:57 coatless

非常感謝你的回答，我在兩分鐘前就明白了:)。我最終使用importClassesFrom（Matrix，dgTMatrix）指令;我瞭解importFrom進口_functions_，而importClasses從進口S4類。無論如何，我正在用roxygen2管理我的NAMESPACE，因此，精確的修改是將'//'@importClassesFrom Matrix dgTMatrix'添加到C++函數頭中，立即在Rcpp :: export屬性之上。另外，只要您確保在NAMESPACE中導入ClassesFrom，我不認爲*** R部分是非常必要的。 – gorgonzola

呃。感謝您收到導入指令snafu。我已經更新了答案。 – coatless

如何在Rcpp代碼中創建R包的S4類的實例

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