將基於指針的結構傳遞給cuda

我有C代碼，它使用指向struct的指針。我試圖找出如何將它傳遞給cuda而沒有太多的運氣。將基於指針的結構傳遞給cuda

我

typedef struct node {  /* describes a tip species or an ancestor */ 
    struct node *next, *back; /* pointers to nodes      */ 
etc... 
} node;

然後

typedef node **pointptr; 
static pointptr treenode;

在我的代碼我經歷了所有這些迭代，而我試圖找出如何將它們傳遞給內核，所以我可以執行以下操作：

for (i = 1; i <= nonodes; i++) { 
    treenode[i - 1]->back = NULL; 
    etc.... 
}

但我想不出如何通過它。任何想法？

來源

2011-11-06 Izri

問題是，爲了在內核中使用您的樹，您的next和back應該可能指向設備內存中的某處。假設你構建主機上的樹，然後通過它，你可以這樣做：

node* traverse(node*n){ 
    if (n==NULL) 
     return NULL; 

    node x, *d; 
    x.back = traverse(n->back); 
    x.next = traverse(n->next); 
    cudaMalloc(&d, sizeof(node)); 
    cudaMemcpy(d, &x, sizeof(node), cudaMemcpyHostToDevice); 
    return d; 
}

，並通過調用它的根你會最終有一個指針樹的根在設備內存，你可以直接傳遞給你的內核。我沒有測試過這個代碼，你必須寫一些類似的東西來刪除樹。

或者，您可以將您的樹節點連續存儲在數組內，索引號爲back和next，而不是指針（如有必要，可能會將其更改回設備代碼中的指針）。

來源

2011-11-06 17:16:09 Vlad