2013-08-16 60 views
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我創建了一個熱圖,並使用樹狀集羣得到以下​​結果顏色:熱圖聚類/聚類值/

enter image description here

亮點,你在該行看到樹狀圖基本上是什麼我米看區分。我需要一種方法來獲取這些特定行的值,或者找到一種方法來獲取與這些行關聯的所有行名稱。或者,是否可以爲每一行設置一個特定的顏色。我不知道任何方法。

原因是我正在創建與熱圖相關的散點圖。實質上,每個行(未包含在熱圖中的名稱)將是散點圖上的一個點,並且每個突出顯示的樹狀圖簇將在散點圖上被分配一種顏色。因此,屬於與每個羣集關聯的行的散點圖上將有6種顏色。

一些例子爲別人在做什麼如下:

Instead of colouring the dendrograms, this adds a bar 相反着色樹形圖的基礎上增加了酒吧

enter image description here 這增加了色彩的樹狀本身

目前,我正在製作熱圖如下:

hm <- heatmap.2(percentMatrix, scale="none", 
cexRow=0.75, cexCol=1.0, key=TRUE, keysize=1.5, 
margins=c(10,22), 
trace="none") 

我很感激一些幫助。

回答

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因此,似乎經過多少修補,我設法弄明白了。我可以簡單地打印hm來獲取地毯,然後解析出訂單。我已經使用cutree爲熱圖添加了一個rowcolorbar。