在R中提交批量時出錯

我試圖在Linux上批量提交R，但通常在提交後30-40分鐘後，過程停止，我收到下面的消息。該消息出現在.Rout文件中，而不是Linux shell中。要提交我用[R CMD批myprogram.R &在R中提交批量時出錯

terminate called after throwing an instance of 'CxException' 
    what():

該項目工程沒有從R內提交自己的問題時，但由於某種原因它通過批量提交時執行中途停止。 創建45000 x 10000矩陣時，此過程停止

下面是該程序的概述。它首先從CSV中讀取三個文件。接下來，它創建一個45000 x 10000矩陣，佔用大約3.7GB的RAM。該矩陣是一個文檔項矩陣，其中1表示當文檔中有一個詞，否則爲0。然後再經過幾個步驟，用矩陣來產生結果。此時RAM增加到約4.5GB，並保持在該水平。我在Linux中監視這項工作，看起來有足夠的空閒資源（CPU和RAM）可供其餘進程運行。

有什麼想法/建議可能導致它？

補充說明：
1）R版本是Revolution R v.6.2; 2）沒有額外的軟件包正在使用;

來源

2013-08-30 vatodorov

是您的算法確定的（沒有隨機的？）任何想法函數被調用，因爲它引發錯誤？你使用什麼軟件包？ – flodel

使用Rscript.exe而不是R CMD BATCH可能會有更好的運氣。

你想使用該語法是：

"%PATH TO EXE%\Rscript.exe" "%PATH TO SCRIPT%\script.R" "INPUT ARGUMENTS (if any)"

來源

2013-08-30 20:05:22 Mustangz

嗨，我試過了，但與R CMD BATCH的結果相同。該過程停止，我得到相同的錯誤。 – vatodorov

這是一些東西，馮-R應該修復它。但是，您可以在R會話中使用源函數執行您的代碼。語法是：

R -e 'source("Your_Script.R")'

來源

2015-12-05 02:02:45 user2684962

在R中提交批量時出錯

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