使用qsub在另一個bash腳本中調用bash腳本

Question

我想在使用qsub的另一個bash腳本中運行bash腳本（因爲我需要在集羣上運行實際問題）。

下面是這個問題的演示。我有兩個腳本如下：

腳本1：

#!/bin/bash -f 
sh ./script2.sh 

腳本2：

#!/bin/bash 
echo "It works fine!" 

現在，如果我把這兩個腳本文件夾中，並使用命令sh script1.sh，它會正常工作。但是，如果使用qsub命令來運行它qsub script1.sh它將通過一個錯誤：

SH：./script2.sh：沒有這樣的文件或目錄

我怎樣才能解決這個問題？

Answer 1

To define the working directory path to be used for the job -d option can be used. If it is not specified, the default working directory is the home directory.

檢查您的工作目錄。

#!/bin/bash -f 
echo "Working directory is $PWD" 
sh ./script2.sh 

您可以使用-d選項來解決這個問題。

qsub -d <working directory> script1.sh