樹形圖高度太長

我使用下面的R代碼獲得一些數據的熱圖;熱圖在列的頂部顯示樹形圖，但我寧願讓樹形圖的長度更短，以便有一些長柱標籤在熱圖底部留下了足夠的空間。有什麼方法可以調整樹狀圖的長度嗎？樹形圖高度太長

<- heatmap.2(t(mully), scale="none", Rowv=F, 
    col = myCol, 
    breaks = myBreaks, 
    dendrogram="row", 
    margins=c(0.55,8.4), cexRow=0.68, cexCol=0.9, key=FALSE, 
    labCol =NULL, 
    trace="none")

我很樂意爲您提供幫助。

詹姆斯

來源

2012-08-13 James Johnson

你會很高興得到一些幫助，我們很樂意有一些數據可以使用。請參閱：http://stackoverflow.com/questions/5963269/how-to-make-a-great-r-reproducible-example – 2012-08-13 03:21:56

您可以嘗試pheatmap包繪製熱圖。

pheatmap(t(mully), colors = myCol, breaks = myBreaks)

如果矩陣太大適當融入繪圖窗口，那麼你就可以修復細胞的高度和寬度，並將結果寫入到文件中。這確保了情節的所有相關部分都將可見。

pheatmap(t(mully), colors = myCol, breaks = myBreaks, cellheight = 10, 
    cellwidth = 10, filename = "example.png")

來源

2012-08-14 07:09:53

非常感謝Raivo。 pheatmap工作得非常好！我非常感謝你的幫助。出於某種原因，我的第一次嘗試只是給我一個只有藍色的熱圖;然後我將「color = mycol」更改爲「col = mycol」，我可以看到所有五種定義的顏色。我不知道它爲什麼起作用。無論如何，我的問題現在已經解決了。非常感謝！ – 2012-08-15 04:15:26

樹形圖高度太長

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