如何在python中創建多個隨機序列？

我試圖製作200個隨機DNA序列，我無法弄清楚如何製作200個DNA序列！這是我到目前爲止有：如何在python中創建多個隨機序列？

from random import random 

def randABCD(n, probA, probT, probC, probG): 
    # where probA + probT + probC + probG == 1 
    # n = number of characters in string 
    # pX = probability of the character 
    cA = probA 
    cT = cA + probT 
    cC = cT + probC 
    def choose(): 
     r = random() 
     if r < cA: 
      return 'A' 
     elif r < cT: 
      return 'T' 
     elif r < cC: 
      return 'C' 
     else: 
      return 'G' 
    return ''.join([choose() for i in xrange(n)])

來源

2015-04-05 Amanda Licht

你想做一件事情200次。你有一個能夠完成這件事的功能。你知道用什麼控制流工具來做一定的事情嗎？ – user2357112 2015-04-05 02:39:56

此代碼將充分利用你的函數，它會產生長度10注200個序列我添加了一行進口隨機改變調用隨意random.random。我也將xrange更改爲範圍，因爲我使用Python 3.x測試了代碼。

讓我知道如果你腦海中還有不同的從第一次印刷的呼叫 AACCGTCTCT

從第二打印通話 [ 'CCAGTTCGGA' 輸出

import random 

def randABCD(n, probA, probT, probC, probG): 
    # where probA + probT + probC + probG == 1 
    # n = number of characters in string 
    # pX = probability of the character 
    cA = probA 
    cT = cA + probT 
    cC = cT + probC 
    def choose(): 
     r = random.random() 
     if r < cA: 
      return 'A' 
     elif r < cT: 
      return 'T' 
     elif r < cC: 
      return 'C' 
     else: 
      return 'G' 
return ''.join([choose() for i in range(n)]) 

print(randABCD(10, .25, .25, .25, .25)) 

print([randABCD(10, .25, .25, .25, .25) for i in range(200)])

輸出

「 ACGGGAAAGT'，'CGTGGTAAGT'，'AACGATTGAG'，'GAGGATATGC'，'AGTGCCTTGT'，'TGACTTGCAC'，'GAAGGAGGCA'，'TCCGGTAGTT'，'TCTGCCGTCG'，'TACATAAGTC'，'GCTGGTTAAC'，'CACCCAGGCC'，'CAAGAGCCAA' ，'GCTATTCGAT'，'GTGCTCATCT'， 'AAAGCAATAC'，'GTATGGAAAC'，'GTATTGGTAA'，'TGTAATCTTA'，'TCGAATACAT'，'TCCTCAATGG'，'TGTAACGGCA'，'TAGTCACTGT'，'CAAAGCTCAT'，'GTTGAAAGTC'，'CTATCATGAG'，'CAAGCACTAT'，'CTGGGCTGCC '，'CATGTCCAGG'，'ACGTGTGATC'，'AATATGCAAC'，'ACTGATGGAT'，'TATCGCGCGA'，'GTAGACCCAA'，'CAGGATGCAT'，'TACGGCAGAG'，'TATTTTATCA'，'GGTAATCACA'，'TAAACGTATG'，'CTTCCACGCG'， GGCTCCAAAA，CAAGAATAAC，TCACGGTCTT，AGCGCGTCGA，TCACTATCAT，TCTGATGTCA，AGAAGGTCGT，TTAGCGTCTC，TGAGATGCGA，ATACCCATGC，ACCGCTCGAG，CCATCAGGCC，AACCTTCCCG '，'TCACTCGGGT'，'CGAGACCGGA'，'GCAAGATGAT'，'TGCAATGAGG'，'CCAGATTGGT'，'GGCGATGACA'，'TAGTATGGTT'，'GCAGGTCTCG'，'GGTTTTAACC'，'ACAACCAACT'，'CTGTTCAGTT'，'TTGGAGAGTA' 'AGTCGATCTG'，'TAATGGCAGG'，'CGTCCTTTAA'，'GCGCAACTTC'，'CGGTAGAATG'，'TCTAGCTTGC'，'GCGAAAGCGC'，'GACCCCCGGC'，'GCAATAGTCT'，'ATTGACTCCT'，'ACTAACGCTT'，'TCATAGAAGC'，'GTAGCTGCGT '，'ACAATCTCCT'，'TCGACTCTCT'，'GGCAACAGCA'，'TATTGTAGAC'，'GAGGTCAACG'，'ATGCCAGGGA'，'CTCTCTTTCT'，'CTGCGTGATA'，'GCAA GAATAC，AATGCATGAC，AGTTCAGGCA，GAGATTCCCC，CCGCCGACCA，ACGACGTGCA，TGAACGCCAA，GTCGGCTATT，TGCTTATCAA，AGGAGGCACG，TCTACTGCGA，GCCTTGACAT，GCCTCTCCCC，，ACACCGACTG，ATTTAATCAT，GTGCAACGTC，GTGTGGCTAA，TGGCGATTAA，GTATGTCTCC，ACTTATGGGC，GCTACGTTTT，ATCCTCACGT，GCCGGCTACA，CCCGTGAAGA，CATGACCACT， GAACCTGATG'，'ACGAGTGTCA'，'ATGTTGGTTT'，'CTTGGAATGA'，'CTTTCCTCAC'，'GATGCTCTTT'，'TAATTCTAAT'，'TCTGGCAAAG'，'CCAGGCCGCG'，'TCATCGCACA'，'CAGCAAGATT'，'GCTTAGGAGG'，'ATATTGTGCG' ，'AATATGACGG'，'TCTAGTCCCT'，'GTAAACCGGA'，'TTTAGCGTAC'，'CGAATAGAAC'，'TTAGAATCGG'，'CGCGCGCCTC'，'AATGTTAAGG'，'ACTCGACGCA'，'GGTTGCTTAC'，'TCTGGTGCTC'，'TAATTAGGTA' GCCTTAGAAG，GTTTATACGC，AGCGTCCATA，GTATTGTCGA，CACCTCAGAA，CCCACCTCCG，AGACGCTAGA，CAAAGCCAGA，TCAAATTCAT，GGCCATTTGT，CAACATGGTA，CAAGTGTAAG，CGCCGTAACC，，'GGGCGGTAAT'，'GTCCAACCAC'，'CGAAGCGCAG'，'GGCGTCGGAG'，'CTTGTCGCGG'，'GCCCTTCTGC'，'TGCAGCCAAC'，'TGATTTGTTC'，'TGAATTCAGT '，'TAGTCCTGCT'，'GCCCTATGGG'，'CCAGGCTGTT'，'TCCTCAAAAC'，'CTACGGGCAT'，'GCCAACCGAG'，'CAATGGAACT'，'CCTTATCCTC'，'TAAAAGGCTA'，'CGCGTGACAC'，'TGGCGAGCGT'，'CCCCGAGCAT' 'CAGCATTCAA'，'TGTACTGTCC'，'TCCTTGGTTA'，'TCAAAGATGT'，'CGCATACTCA'，'GAATCTATTT'，'ATCATAAGGT'，'ACGCTCTCGC'，'GTCCTCTTAA'，'ATCCGAACCT'，'TGGACTTCCG'，'TCAGATGATA'，'ACTTCATGCG '，'TCCTATACAA'，'ATGGTCTTTA'，'CTAATTCGGT'，'TGCACCACAT'，'GTGACCGTCT'，'ACGTCAGTCA'，'TCTTCCACCT'，'CCGAATACGC'，'ACTATGTCGT'，'TACTATTCCC'，'GGGGGACGCA'，'TGCAGGTTCT'， 'GGCTCTGGGG'，'TGGAGCGCTC'，'CGAGATCTTA'，'GGCTTGGCAT']

來源

2015-04-05 02:40:02

如何在python中創建多個隨機序列？

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