如何在Numpy中批量選擇和計算數組？

如何（1）批量選擇hdf5文件下的所有數組，然後（2）對這些數組應用計算，最後（3）在另一個hdf5文件中批量創建新數組？如何在Numpy中批量選擇和計算數組？

例如：

import numpy 
import tables 

file = openFile('file1',"r") 

array1 = file.root.array1 
array1_cal = (array1 <= 1) 
newfile.createArray('/','array1_cal',array1_cal) 

array2 = file.root.array2 
array2_cal = (array2 <= 1) 
newfile.createArray('/','array2_cal',array2_cal)

我下單HDF5文件和幾個HDF5文件100+陣列，我怎麼能批量處理他們？非常感謝。

來源

2012-05-10 l.z.lz

你的HDF文件的結構是什麼？例如，所有的數組都掛在根上？你是否希望在新文件中複製該結構？ – dtlussier

隨着PyTables可以使用walkNodes功能通過遞歸迭代的節點。這裏是一個例子：

# Recursively print all the nodes hanging from '/detector'. 
print "Nodes hanging from group '/detector':" 
for node in h5file.walkNodes('/detector', classname='EArray'): 
    data = node[:] 
    // do some calculation 
    // store new array in second file

來源

2012-05-10 09:12:47

使用h5py，Python接口到HDF5。 h5py允許您使用傳統的Python和NumPy隱喻使用HDF5文件，組和數據集。

看到http://code.google.com/p/h5py/和http://alfven.org/wp/hdf5-for-python/

來源

2012-05-10 08:12:36

如何在Numpy中批量選擇和計算數組？

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