2016-02-05 82 views
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我正在尋找一個程序來可視化數據樹。它很小,有大約20個節點。我想適合用於矢量圖形格式,例如PDF,SVG呈現的曲線圖等可視化樹數據

輸入端連接的節點對的簡單列表,像這樣:

specie,monosaccharide 
specie,polysaccharide 
specie,protein 
specie,nucleic_acid 
nucleic_acid,DNA 
nucleic_acid,RNA 
RNA,mRNA 
RNA,ncRNA 

Cytoscape的似乎太複雜了,Graphviz似乎死了(網站無響應),Gephi甚至不會在其教程中繪製第一個例子。

我想在我的Mac上運行圖形程序,我很樂意編寫一個小程序,最好是Pyton或Perl來生成圖形。

請推薦?

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令我驚訝的是Graphviz網站不可用,它應該是暫時的。我建議你使用igraph來代表你的python圖表。查看提示here並照常檢查文檔和tutorial