如何避免使用基本圖的重疊繪圖（對於點）？

我正在完成一篇論文的圖表，並決定（after a discussion on stats.stackoverflow），爲了傳輸儘可能多的信息，創建下面的圖表，在前景中顯示手段和背景中的原始數據： alt text 如何避免使用基本圖的重疊繪圖（對於點）？

但是，仍然存在一個問題，那就是重疊繪圖。例如，標記的點看起來像是反映了一個數據點，但實際上有5個數據點在該位置具有相同的值。
因此，我想知道是否有一種方法可以使用points作爲函數來處理base graph中的重疊繪圖。
如果例如，各點越暗，或厚或，這將是理想的...

做手工是不是一個選項（太多的圖形，並指出這樣的）。此外，ggplot2也不是我想要學習處理這個單一問題的原因（其中一個原因是我傾向於喜歡雙軸不在ggplot2中提供）。

更新：我寫自動創建上述圖表，並通過添加垂直或水平抖動避免overplotting的函數（或兩者）：check it out!

此功能現在可作爲raw.means.plot和raw.means.plot2在plotrix包（在CRAN上）。

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2010-08-27 Henrik

標準方法是在繪圖之前向數據添加一些噪音。 R有一個函數jitter（），它正是這樣做的。您可以使用它將必要的噪音添加到您的情節中的座標。例如：

X <- rep(1:10,10) 
Z <- as.factor(sample(letters[1:10],100,replace=T)) 

plot(jitter(as.numeric(Z),factor=0.2),X,xaxt="n") 
axis(1,at=1:10,labels=levels(Z))

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2010-08-27 13:04:15

我通過編寫一個小函數來擴展這種方法，該函數只是將抖動（即均勻噪聲）添加到副本中。現在我很開心。 – Henrik 2010-08-27 13:48:06

使點更小。 – John 2010-08-27 16:48:13

此外抖動，另一個很好的方法是α混合，其可以獲取（在圖形裝置supporing它）作爲第四顏色參數。我在this SO question中提供了兩個直方圖的「重疊繪圖」示例。

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2010-08-27 13:26:17

從來沒有想過在這種情況下使用alpha混合，好主意。您可以將兩者結合起來，這樣您仍可以看到各個點： plot（抖動（as.numeric（Z），factor = 0.2），X，xaxt =「n」，col = rgb（0,0,0， 0.5）） – 2010-08-27 13:48:44

您也可以使用sunflowerplot，但在這裏很難實現。正如德克所建議的那樣，我會使用阿爾法混合。

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2010-08-27 13:31:43 mbq

顯示點數的常見問題的另一個想法是使用地毯圖（地毯功能），這沿着邊緣放置了小刻度線，可以顯示多少點貢獻（仍然使用抖動或alpha混合領帶）。這允許實際點顯示其真實值而不是抖動值，但地毯可以指示該圖的哪些部分具有更多值。

對於示例圖直接抖動或alpha混合可能是最好的，但在其他一些情況下，地毯情節可能是有用的。

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2010-08-27 15:20:32

如何避免使用基本圖的重疊繪圖（對於點）？

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