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我在我的home文件夾下安裝了R,並且我想在將作業提交給羣集時調用新的R。羣集節點都安裝了CentOS。別名在qsub後不起作用
下面是我在.bash_profile文件和.bashrc中所做的配置:
if [ `lsb_release -i|cut -c17-20` == 'Cent' ] ; then
alias R='/home/XXX/R-3.0.2/bin/R'
alias Rscript='/home/XXX/R-3.0.2/bin/Rscript'
fi
我加入的.bash_profile如下:
if [ -f ~/.bashrc ]; then
source ~/.bashrc
fi
我還添加了這所提交的腳本。
source $HOME/.bash_profile
我試着用qsub -I,它工作的很完美。
但是,我提交作業後,which R
仍然顯示原始路徑!
如何正確設置環境?
謝謝@janos。我創建了一個.env文件,並在其中添加了PATH =「/ home/XXX/R-3.0.2/bin:$ PATH」,然後在if命令中檢測到CentOs時源文件。 – shao