biojava軟件包導入錯誤

Question

我已經下載了biojava jar文件並保存在我的類路徑中。我想例如，從測試：http://www.biojava.org/wiki/BioJava:CookBook:Core:FastaReadWrite

，但是，它給我的錯誤：

error: package org.biojava3.core.sequence does not exist 
import org.biojava3.core.sequence.ProteinSequence; 

我在網站上顯示的示例文件的24個錯誤。我在課堂路徑中保存了jar文件。那爲什麼這給了我錯誤？我錯過了任何一步？

Answer 1

請檢查您的班級路徑設置和biojava版本。

我從網頁上看到了biojava 3.0.7版本的例子。 這裏是我做了什麼

• 下載biojava.jar

  wget http://biojava.org/download/maven/org/biojava/biojava3-core/3.0.7/biojava3-core-3.0.7.jar 
  

• 創建一個包含從您的鏈接採取

• 編譯

  javac -cp .:biojava3-core-3.0.7.jar FastaOpen.java 
  

• 代碼的Java文件FastaOpen.java

  執行

  java -cp .:biojava3-core-3.0.7.jar FastaOpen 
  Exception in thread "main" java.lang.ArrayIndexOutOfBoundsException: 0 
  at FastaOpen.main(FastaOpen.java:20) 
  

唯一的例外是確定的，因爲我沒有指定一個文件名。 因此，對我來說，這個例子正在工作。如果我在編譯時沒有指定類路徑，我會得到和你一樣的錯誤，例如：

FastaOpen.java:5: error: package org.biojava3.core.sequence does not exist 
import org.biojava3.core.sequence.ProteinSequence; 

上面的描述適用於Linux。在MS Windows，你應該嘗試類似follwing命令的東西（在PowerShell中發佈）

• 編譯

  PS > & 'C:\Program Files\Java\jdk1.7.0_45\bin\javac.exe' -cp "C:\Users\stefan\Downloads\biojava3-core-3.0.7.jar" .\FastaOpen.java 
  

• 執行

  PS > & 'C:\Program Files\Java\jdk1.7.0_45\bin\java.exe' -cp "C:\Users\stefan\Downloads\biojava3-core-3.0.7.jar;C:\Users\stefan\Downloads" FastaOpen 
  

  （這兩個文件，Java源/類和jar位於Downloads目錄中。