Biopython腳本不工作，它發送errortype生成器

Question

我有幾個錯誤，當我嘗試使用biopython解析xml文件時，我不明白，任何人都可以幫助我理解這一點嗎？

TypeError: object of type 'generator' has no len() 

    from Bio import SearchIO 
    blast_qresults=SearchIO.parse('my_file.xml', 'blast-xml') 
    len(blast_qresults) 

    or 

    blast_qresults.hit 

AttributeError: 'generator' object has no attribute 'hit 

Answer 1

我相信這是你想要的語法：

from Bio import SearchIO 

blast_qresults = SearchIO.parse('my_file.xml', 'blast-xml') 

for hit in blast_qresults: 
    print(hit) 

由於blast_qresults是一臺發電機，你只能「走」了一次。