LSF - 獲取提交作業的ID

說我使用類似bsub pwd的東西提交一份工作。現在我想獲得該職位的工作ID，以便爲下一份工作建立一個依賴關係。有什麼方法可以讓bsub返回作業ID？LSF - 獲取提交作業的ID

2012-08-23 Nils

作爲參考，這是迄今爲止我可以提出的最佳解決方案。它利用了bsub將包含ID的行寫入STDOUT的事實。

function nk_jobid { 
    output=$($*) 
    echo $output | head -n1 | cut -d'<' -f2 | cut -d'>' -f1 
}

用法：

jobid=$(nk_jobid bsub pwd)

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2012-08-23 14:41:52 Nils

它的語言是什麼？ –

@AndreyRubshtein多數民衆贊成在。 – jsmedmar

我想知道如何在$（nk_jonid bsub $ VARIABLE） – jsmedmar

$jobid = "0" 
bsub pwd > $jobid 
cat $jobid

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2013-04-26 07:54:05

如果您使用的是C++，你可以使用lsblib，LSF C API提交作業。輸入和輸出是結構。特別是，輸出結構體包含作業ID。

#include <lsf/lsbatch.h>  
LS_LONG_INT lsb_submit (struct submit *jobSubReq, struct submitReply *jobSubReply)

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2013-05-12 15:19:07

Nils和Andrey分別在shell和C/C++環境中解答了這個特定問題。對於建築的依賴的目的，你也可以命名你的工作和-J然後建立基於作業名的依賴：

bsub -J "job1" <cmd1> 
bsub -J "job2" <cmd2> 
bsub -w "done(job1) && done(job2)" <cmd>

有更多的信息here。

這也適用於工作數組：

bsub -J "ArrayA[1-10]" <cmd1> 
bsub -J "ArrayB[1-10]" <cmd2> 
bsub -w "done(ArrayA[3]) && done(ArrayB[5])" <cmd>

你甚至可以做元素乘元素的依賴。下面作業的我個元素將只運行時ArrayB相應的元件達到DONE狀態：

bsub -w "done(ArrayB[*])" -J "ArrayC[1-10]" <cmd3>

你可以找到各種各樣的事情更多信息，你可以在-where指定。

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2013-09-12 15:11:52 Squirrel

（+1）中傳遞一個變量，你注意到了問題的實際意圖。 –

這是好的，但它不適用於作業數組... – jsmedmar

@jsmedmar其實，它的確如此。我會在答案中添加一些細節。 – Squirrel

如果您只是想在提交後查看JOBID，大部分時間我只會使用bhist或bhist -l來查看正在運行的作業和詳細信息。

$ bhist 
Summary of time in seconds spent in various states: 
JOBID USER JOB_NAME PEND PSUSP RUN  USUSP SSUSP UNKWN TOTAL 
8664 F14r3 sample  2  0 187954 0  0  0  187956

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2013-11-25 16:01:07 F14r3

LSF - 獲取提交作業的ID

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