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我試圖在第一列上拆分覆蓋文件(製表符定界符),以便每個染色體都有一個特定的文件。在第一列上拆分
我已經與
cat file.coverage | awk ' { if ($1 == "chrn"){print}}'
但這種方式我已經爲正樣本做n次完成。
我想這樣做的遞歸方式:讀取第一列,而chr是相同的,打印出來的文件A
,否則打印在文件B
等。
我該如何做到這一點?
我試圖在第一列上拆分覆蓋文件(製表符定界符),以便每個染色體都有一個特定的文件。在第一列上拆分
我已經與
cat file.coverage | awk ' { if ($1 == "chrn"){print}}'
但這種方式我已經爲正樣本做n次完成。
我想這樣做的遞歸方式:讀取第一列,而chr是相同的,打印出來的文件A
,否則打印在文件B
等。
我該如何做到這一點?
由於@Tensibai在評論中指出的,你可以做 -
awk '{print >> $1".log"}' file.coverage
Explanation-
的awk
一個襯墊就追加線成根據在第一列的索引命名的文件。
您不需要cat filename | awk
。 awk
能夠自行讀取文件。這是無用的使用cat
。
在另一個方面說明(爲你寫代碼的未來),你的初始行可能TO-
awk '$1 == "chrn"' file.coverage
無需爲if
縮短。
'''就夠了,它會被追加。 – karakfa
舉例說明您的輸入和預期輸出。 – Inian
...'awk'{print >> $ 1「.log」}'file.coverage'? (注意:不需要cat和pipe,只需讓awk讀取文件本身。) – Tensibai
「我必須做n次n樣本」 - 請使用簡單的英文。我們不知道什麼是「n次樣本n次」。同時,-1的問題。 – user31264