這個問題是一個直接的後繼問題,在這裏被稱爲「帶有X和Y誤差條的疊加平均值的兩組ggplot散點圖」。那個問題的答案看起來正是我要完成的事情,但是提供的代碼導致了一個我無法解決的錯誤。我將在這裏使用我的數據作爲示例,但我也嘗試了原始問題代碼以及相同的結果。 我有一個數據幀,看起來像這樣:ggplot2散點圖與平均值和雙向SD條重疊
structure(list(Meta_ID = structure(c(15L, 22L, 31L, 17L), .Label = c("NM*624-46",
"NM*624-54", "NM*624-56", "NM*624-61", "NM*624-70", "NM624-36",
"NM624-38", "NM624-39", "NM624-40", "NM624-41", "NM624-43", "NM624-46",
"NM624-47", "NM624-51", "NM624-54 ", "NM624-56", "NM624-57",
"NM624-59", "NM624-61", "NM624-64", "NM624-70", "NM624-73", "NM624-75",
"NM624-77", "NM624-81", "NM624-82", "NM624-83", "NM624-84", "NM625-02",
"NM625-10", "NM625-11", "SM621-43", "SM621-44", "SM621-46", "SM621-47",
"SM621-48", "SM621-52", "SM621-53", "SM621-55", "SM621-56", "SM621-96",
"SM621-97", "SM622-51", "SM622-52", "SM623-14", "SM623-23", "SM623-26",
"SM623-27", "SM623-32", "SM623-33", "SM623-34", "SM623-55", "SM623-56",
"SM623-57", "SM623-58", "SM623-59", "SM623-61", "SM623-62", "SM623-64",
"SM623-65", "SM623-66", "SM623-67", "SM680-74", "SM681-16"), class = "factor"),
Region = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L), .Label = c("N", "S"
), class = "factor"), Tissue = structure(c(1L, 2L, 1L, 1L
), .Label = c("M", "M*"), class = "factor"), Tag_Num = structure(c(41L,
48L, 57L, 43L), .Label = c("621-43", "621-44", "621-46",
"621-47", "621-48", "621-52", "621-53", "621-55", "621-56",
"621-96", "621-97", "622-51", "622-52", "623-14", "623-23",
"623-26", "623-27", "623-32", "623-33", "623-34", "623-55",
"623-56", "623-57", "623-58", "623-59", "623-61", "623-62",
"623-64", "623-65", "623-66", "623-67", "624-36", "624-38",
"624-39", "624-40", "624-41", "624-43", "624-46", "624-47",
"624-51", "624-54", "624-56", "624-57", "624-59", "624-61",
"624-64", "624-70", "624-73", "624-75", "624-77", "624-81",
"624-82", "624-83", "624-84", "625-02", "625-10", "625-11",
"680-74", "681-16"), class = "factor"), Lab_Num = structure(1:4, .Label = c("C4683",
"C4684", "C4685", "C4686", "C4687", "C4688", "C4689", "C4690",
"C4691", "C4692", "C4693", "C4694", "C4695", "C4696", "C4697",
"C4698", "C4699", "C4700", "C4701", "C4702", "C4703", "C4704",
"C4705", "C4706", "C4707", "C4708", "C4709", "C4710", "C4711",
"C4712", "C4713", "C4714", "C4715", "C4716", "C4717", "C4718",
"C4719", "C4720", "C4721", "C4722", "C4723", "C4724", "C4725",
"C4726", "C4727", "C4728", "C4729", "C4730", "C4731", "C4732",
"C4733", "C4734", "C4735", "C4736", "C4737", "C4738", "C4739",
"C4740", "C4741", "C4742", "C4743", "C4744", "C4745", "C4746",
"C4747", "C4748"), class = "factor"), C = c(46.5, 46.7, 45,
43.6), N = c(12.9, 13.7, 14.5, 13.4), C.N = c(3.6, 3.4, 3.1,
3.3), d13C = c(-19.7, -19.5, -19.4, -19.2), d15N = c(13.3,
12.4, 11.7, 11.9)), .Names = c("Meta_ID", "Region", "Tissue",
"Tag_Num", "Lab_Num", "C", "N", "C.N", "d13C", "d15N"), row.names = c(NA,
4L), class = "data.frame")
我想生產與數據的覆蓋原始數據的散點圖意味着每個「區」與雙向誤差條。爲了做到這一點,我使用plyr來總結我的數據並生成手段和標準。然後我用GGPLOT2:
library(plyr)
Basic <- ddply(First.run,.(Region),summarise,
N = length(d13C),
d13C.mean = mean(d13C),
d15N.mean = mean(d15N),
d13C.SD = sd(d13C),
d15N.SD = sd(d15N))
ggplot(data=First.run, aes(x = First.run$d13C, y = First.run$d15N))+
geom_point(aes(colour = Region))+
geom_point(data = Basic,aes(colour = Region))+
geom_errorbarh(data = Basic, aes(xmin = d13C.mean + d13C.SD, xmax = d13C.mean - d13C.SD,
y = d15N.mean, colour = Region, height = 0.01))+
geom_errorbar(data = Basic, aes(ymin = d15N.mean - d15N.SD, ymax = d15N.mean + d15N.SD,
x = d13C.mean,colour = Region))
但每次我運行此代碼時,我得到了同樣的錯誤,並不能找出問題所在。 錯誤:美學必須是長度爲1或與dataProblems的長度相同:區域
任何幫助將不勝感激。
編輯:由於我的示例數據是從我的完整數據集的頭部獲取的,因此它只包含來自「N」區域的樣本。只有這一個區域的代碼可以正常工作,但如果使用fix()更改提供的數據集,以便至少包含一個其他區域(在我的數據中另一個區域是「S」),則會顯示出現的錯誤。我的錯誤是不包括每個地區的一些數據。
這對我來說沒有錯誤,對於您提供的小數據集運行。您的R/ggplot2是最新的? – aosmith
謝謝你指出這一點。我已經添加了一個編輯來解決這個問題。請使用fix()手動將其中一個「N」區域更改爲「S」,以便我的數據中的兩個區域都被表示出來。然後發生錯誤。對不起,疏忽了。 – 2ton21