2014-03-31 78 views
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我正在做免疫組化,我有兩個不同的信號,想做細胞計數。在ImageJ中可以做一個「全景多維堆棧」嗎?

我的想法是在二維(標記1,標記2)中使用z堆棧(20幀)。對於我來說,這對於一張圖片來說不成問題。但是,我所看到的區域很大,我想使用高放大倍數,所以我想將不同的圖像合併爲一個非常大的圖像,這也是z-堆疊在兩個標記中。

這可能嗎,任何提示?

編輯:另外,要注意,我沒有一個共焦顯微鏡可用於電動舞臺,只有普通的落射熒光顯微鏡沒有這個變化的階段。

感謝, 普拉茲

回答

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只要你的圖像包含大量的重疊(不需要機動階段,只要確保兩個相鄰的圖片分享他們的邊境一些視覺功能),你可以使用Stitching插件附帶Fiji

  • 插件>縫合>網/收藏拼接
  • 在第一個對話框中,選擇類型:UNK nown位置

如果你的不同的Z層次和色彩通道都在不同的文件中,則可能必須將它們組合成hyperstacks(圖像>彩色>合併通道...)第一縫合前。

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