imagej

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我對imageJ中的批量圖像處理非常新穎。我有一個宏，它允許我在一個目錄中處理多個圖像。問題在於宏爲每個處理後的圖像生成一個單獨的摘要窗口，讓我手動將所有輸出數據編譯爲一個.csv或.xls。我寧願將所有彙總數據自動編譯爲一個文件。雖然我發現有幾個來源顯示如何做到這一點，但在我的情況下，它並沒有特別有用。如果你能幫忙，我會非常感激。下面是代碼的縮寫例如： dir1 = getDirector

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ImageJ-在圖像上顯示像素值

我有一個小圖像，我想在ImageJ中的圖像上顯示每個像素值，而不是指向每個像素並逐個查看值。有沒有辦法做到這一點？

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更改ImagePlus圖像顏色

我試圖更改imagePlus類型的圖像顏色，但我無法這樣做。下面IST爲他的代碼，圖像是黑白 ImagePlus t= IJ.openImage("image.tif"); ImageStack c = new ImageStack(t.getWidth(), t.getHeight()); c.addSlice(t.getStack().getProcessor(1));

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ImageJ：導出多個圖像的柱狀圖列表

經過數小時的嘗試和搜索相關主題，我沒有更進一步。我正在嘗試創建一個小型ImageJ腳本，用於分割圖片的通道，並保存爲具有增強對比度的.tif版本（本部分工作）並創建直方圖並將其值保存爲.csv（此部分不起作用，它不保存任何東西）。我不知道爲什麼它不起作用，所以這是我的整個代碼。 input = getDirectory("Input directory"); output = getDirec

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SimpleITK.Show（）ImageJ中在Linux上生成錯誤

編輯注：這個問題最初表述爲如何在Linux SimpleITK.Show（）鏈接到ImageJ的？通過將SimpleITK 1.0.0升級到1.0.1，我能夠從SimpleITK.Show（）啓動ImageJ。但ImageJ無法打開「sample_mri.hdr」。 ImageJ生成以下錯誤消息。文件是不支持的格式，讀者插件不可用，或者沒有被發現。 root/local/linux/Im

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將JNI庫封裝在jar文件中

我正在嘗試爲斐濟/ ImageJ開發一個依賴本機庫（JNI）的插件。 JNI庫本身取決於libtiff和fftw。在OSX和Linux上，我使用類NativeUtils，一切正常。在windows上，我在CMake包中包含了libtiff和fftw的二進制版本，並設法將JNI庫與那些（靜態地動態地）鏈接起來。但是，生成的JNI模塊不包含libtiff或fftw，並且當我嘗試加載帶有NativeU

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如何加載保存爲tiff文件的二進制輪廓的XY座標？

我使用R包Momocs來比較ImageJ中描繪的形狀輪廓，並將其保存爲二進制圖像tiff。例如：one outline of snail teeth。 Momocs需要一個X和Y座標矩陣，而且我無法將圖像轉換爲座標。一方面：ImageJ可以選擇另存爲... XY座標，但這隻適用於選擇。我可以使用魔杖工具選擇輪廓，但它包圍了一個像素寬的輪廓，例如直線將具有長矩形的座標，描述該線的兩側。這讓我看到我的

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將ImageJ宏轉換爲插件

我有一個概念性的問題，所以對於非特定的道歉。我是一名生物學家，並從事圖像分析工作。我正在研究方法出版物，其中包括使用我開發的ImageJ腳本進行圖像分析，並使用我們的R包進行數據分析。理想情況下，我們希望發佈我們的數據，分發宏，並通過Web應用程序提供分析結果。我們的目標是使這種方法適用於幾乎沒有電腦知識的人。所以我想了解是否需要將我的宏開發爲插件。到目前爲止，據我所知，開發一個插件可能會加速

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遞歸函數javascript concat數組結果 - ImageJ

我嘗試爲ImageJ創建一個javascript代碼，它必須允許我選擇一個目錄，並將所有jpg和jpeg文件返回給目錄和子目錄。我已經做了這段代碼，它對直接孩子來說很好，他在子目錄（我用一些IJ.log驗證了它）上調用了getJpeg，但是jpeg數組不是連續的，一個主意？ importClass(Packages.ij.IJ); importClass(Packages.ij.plugin.

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imageJ/FIJI：我可以在投資回報率管理器列表的中間添加一個新的投資回報率

我有一些代碼可以按照特定順序處理保存的投資回報列表。我試圖回過頭來添加投資回報率，但只能將它們添加到投資回報率管理器中的投資回報列表的末尾。有沒有辦法將它們添加到特定的地方？感謝