Intel MPI mpirun不會使用java Process.destroy（）終止

我的Intel MPI版本是在RHEL機器上安裝的impi/5.0.2.044/intel64版本。Intel MPI mpirun不會使用java Process.destroy（）終止

我用java使用下面的代碼來調用MPI程序：

ProcessBuilder builder = new ProcessBuilder(); 
builder.command("mpirun ./myProgram"); 
builder.redirectError(Redirect.to(new File("stderr"))); 
builder.redirectOutput(Redirect.to(new File("stdout"))); 
Process p = null; 
try { 
    p = builder.start(); 
} catch (IOException e) { 
    e.printStackTrace(); 
} 
// Process has started here 
p.destroy(); 
try { 
    // i = 143 
    int i = p.exitValue(); 
} catch(IllegalThreadStateException e){ 
}

但exitValue()沒有拋出異常被稱爲後，也ps aux仍然顯示了一堆./myProgram和程序還在寫結果文件就好像它沒有被殺死一樣，只有在它完成了所有的計算後才終止。

目前，我發現成功終止./myProgram的唯一方法是在控制檯的java程序中使用Ctrl+C終止java。

我的意圖是立即停止計算並讓java程序計劃一些其他計算。是否有任何步驟來強制所有mpi實例終止，或者至少保證在一定的時間內（例如30秒或1分鐘的輪詢）終止？

來源

2015-08-26 kftse

問題是，destroy的JDK實現發送SIGTERM，這會很難關閉mpirun。有關JDK源代碼，請參閱here。

您需要發送SIGINT才能讓MPI有機會正常關機。

E.g. Runtime.getRuntime().exec("kill -9 <pid>");

您可以通過調用mpirun和--report-pid來獲得PID。（閱讀手冊頁）

編輯

您也可以使用反射來計算你的類UNIX操作系統（從here被盜）下啓動的過程中出了PID。正如我們在談論殺戮和信號，這不應該是一個限制。

if(process.getClass().getName().equals("java.lang.UNIXProcess")) { 
    /* get the PID on unix/linux systems */ 
    try { 
    Field f = process.getClass().getDeclaredField("pid"); 
    f.setAccessible(true); 
    pid = f.getInt(p); 
    } catch (Throwable e) { 
    } 
}

來源

2015-08-26 11:34:24 marc

現在我明白了問題所在。我殺死了MPI啓動器，但不是程序。然而，我的'mpirun'版本不會響應'--report-pid'選項和'I_MPI_DEBUG'環境變量，所以我不知道如何獲得PID。 – kftse

請參閱編輯以查找java的pid的通用方法。 – marc

感謝您的反射代碼。我應該接受你的解決方案，因爲它通常是正確的。但是，英特爾MPI仍然詛咒不傳播我的信號。我嘗試了掛斷（1），中斷（2），終止（9）和終止（15），無論是否終止，或者使守護進程死掉而不終止MPI進程。 – kftse

Intel MPI mpirun不會使用java Process.destroy（）終止

回答

相關問題