如果我有一個像在numpy中實例化結構化dtype的語法是什麼?
foo = dtype([('chrom1', '<f4', (100,)), ('chrom2', '<f4', (13,))])
一個D型我怎樣才能創建一個D類的一個實例,作爲一個標量。
背景,如果有一個更好的辦法:
我想直接有效的標量代表映射陣列在基因組的基礎上,通過染色體染色體。我不想要這些基因組數組的數組,每一個都只是一個結構化的標量集,我想通過名稱/位置來引用,並且能夠添加/減去/ etc。
看來,dtype.type()也許是前進的路徑,但我還沒有找到有用的文檔,以正確調用此功能呢。
所以假設我有:
chrom1_array = numpy.arange(100)
chrom2_array = numpy.arange(13)
genomic_array = foo.type([chrom1_array, chrom2_array])
最後一行是不對的,但希望它傳達什麼我目前嘗試。
這是一個可怕的想法?如果是這樣,什麼是正確的想法?如果沒有,那麼實施它的正確方法是什麼?
這類作品,但可怕的:
bar = np.zeros(1, dtype=[('chrom1', 'f4', 100), ('chrom2', 'f4', 13)])[0]
我認爲你可以得到的最接近的是 「標量陣列」:'欄= NP。數組((chrom1_array,chrom2_array),dtype = foo)'。 'bar'是一個形狀爲'()'的數組。 – 2014-11-05 00:21:00
這些「genomic_array」有多少?你在做什麼樣的數學運算?到目前爲止,您的描述不適合使用結構化數組。多維數組是您高效運算的最佳選擇,而類/對象最適合定義複雜對象。 – hpaulj 2014-11-05 05:47:13