在ggbiplot中更改點顏色和形狀

我正在使用ggbiplot（）並希望操作數據點的顏色和形狀，以使它們更易於打印。目前，我從ggbiplot（）獲得了默認的彩虹。我嘗試過使用參數「+ scale_colour_discrete」和「+ scale_shape_manual」，但「groups =」參數ggbiplot似乎覆蓋了這些參數。如果我消除「groups =」參數，則不能繪製橢圓。「+主題」的論點工作得很好。我的代碼如下。我知道我可以在常規biplot（）函數中更容易地操縱顏色/形狀，但我喜歡ggbiplot（）提供的置信區間橢圓。在ggbiplot中更改點顏色和形狀

g <- ggbiplot(size.pca, choices=1:2, obs.scale = 1, var.scale = 1, 
     groups=fieldnames, ellipse = TRUE,ellipse.prob=0.68, varname.size=4) 

g <- g + scale_colour_discrete(name=" ") #only the name=" " part of this seems to work. 

g <- g + scale_shape_manual(values=c(17,16,16,16,16,16), name= " ") #trying to indicate one population different from the rest, but it doesn't seem to do anything (no error either, just no change in the output). 

g <- g + theme_bw() +theme(legend.direction = 'horizontal', 
     legend.position = 'top') 

print(g)

來源

2015-05-06 Sarah L

如果您提供了一些樣本輸入數據，那麼我們就可以看到您的情節，並測試可能的解決方案。在[如何創建可重現的示例]中查看包含數據的提示（http://stackoverflow.com/questions/5963269/how-to-make-a-great-r-reproducible-example） – MrFlick

查看此答案：http： //stackoverflow.com/a/40305464/4477364 – Joe

一個geom_point()參數添加到您的ggplot腳本和scale_color_manual覆蓋組的默認顏色不改變分組載體是這樣的：

g <- ggbiplot(size.pca, choices=1:2, obs.scale = 1, var.scale = 1, 
     groups=fieldnames, ellipse = TRUE,ellipse.prob=0.68, varname.size=4) + 
geom_point(aes(colour = fieldnames), size = "your size") + 

scale_color_manual(values=c(17,16,16,16,16,16)) + 

theme_bw() +theme(legend.direction = 'horizontal', 
     legend.position = 'top') 

print(g)

這應該工作！

來源

2015-10-31 13:09:26

在ggbiplot中更改點顏色和形狀

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