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所以我對Shiny有點新,但不能爲我的生活,弄清楚如何將滑塊輸入值組織到一個命名列表。現在,我有一個UI設置,允許11個輸入。閃亮的滑塊輸入到命名列表
library(shiny)
shinyUI(pageWithSidebar(
headerPanel("Quorom Sensing Model"),
sidebarPanel(
sliderInput("n", "Hill Coefficient:",
min=0, max=10, value=2, step=0.5),
sliderInput("K", "Max Contribution to lacI transcription:",
min=0, max=50, value=20, step=1),
sliderInput("k0_AI", "Initial Synthesis Rate of AI:",
min=0, max=5, value=3.5, step=0.1),
sliderInput("k1_AI", "Repressor dependent rate of synthesis of AI:",
min=0, max=1, value=.033, step=0.001),
sliderInput("eta", "diffusion rate of AI across cell membrane:",
min=0, max=5, value=.7, step=0.1),
sliderInput("k_deg", "extracellular AI degredation Rate:",
min=0, max=1, value=.525, step=0.001),
sliderInput("k_diff", "extracellular diffusion rate of AI:",
min=0, max=10, value=2.1, step=0.1),
sliderInput("alpha_tetR", "Alpha tetR:",
min=0, max=50, value=24, step=1),
sliderInput("alpha_cI", "Alpha cI:",
min=0, max=50, value=24, step=1),
sliderInput("alpha_lacI", "Alpha lacI:",
min=0, max=50, value=24, step=1),
sliderInput("beta", "Ratio of protein decay to mRNA decay rate:",
min=0, max=10, value=1.05, step=0.05)
),
mainPanel(
plotOutput("timeSeries"),
plotOutput("timeSeries2")
))
)
因此,這些滑塊輸入需要送入命名列表,其中參數(命名列表)= C(N =輸入$ N,K =輸入$ K,等的值),使得我可以將指定的號碼列表輸入到生成輸出所需的數學函數中。
現在,我具備的功能參數,可以返回基於輸入變量命名列表:
params <- function(n = 2,
K=20,
k0_AI=3.5,
k1_AI=0.033,
eta=0.7,
k_deg=0.525,
k_diff=2.1,
alpha_tetR=24,
alpha_cI=24,
alpha_lacI=24,
beta=1.05){
paramlist <- c(n = n,
K = K,
k0_AI = k0_AI,
k1_AI = k1_AI,
eta = eta,
k_deg = k_deg,
k_diff = k_diff,
alpha_tetR = alpha_tetR,
alpha_cI = alpha_cI,
alpha_lacI = alpha_lacI,
beta = beta)
return(paramlist)
}
這是從server.R和輸入變量稱爲被設置爲輸入$等滑塊?
library(shiny)
library(ggplot2)
library(reshape2)
library(deSolve)
source("params.R")
shinyServer(function(input,output){
parameters = reactive({
params(n = input$n,
K = input$K,
k0_AI = input$k0_AI,
k1_AI= input$k1_AI,
eta = input$eta,
k_deg = input$k_deg,
k_diff = input$k_diff,
alpha_tetR = input$alpha_tetR,
alpha_cI = input$alpha_cI,
alpha_lacI =input$alpha_lacI,
beta = input$beta
)
})
錯誤的eval(代用品(表達式),數據,enclos = parent.frame()): 無效 'ENVIR' 類型 '閉合'
的說法再次,我所需要的輸入值的滑塊成爲命名列表的一部分,滑塊的名稱=列表的值和名稱可以從函數中調用。我怎麼能最輕鬆地做到這一點?謝謝!
非常感謝您的幫助!我是否需要用反應式表達來包裝它?我現在有這樣的(級聯以兩個參數): '參數< - reactiveValues() 參數$ N =輸入$ N 參數$ K =輸入$ķ PARAMS < - reactiveValuesToList(分離物(參數))' 但是得到這個: '.getReactiveEnvironment()中的錯誤$ currentContext(): 沒有一個活動的被動上下文,操作是不允許的。 – markowonk
如果你真的需要隔離這些值,試着把隔離放在外面:'params <-isolate (reactiveValuesToList(parameters))' –
Thanks @JohnP!我是否需要將它封裝在一個反應式()表達式中? – markowonk