2017-01-25 208 views
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我使用的是熊貓,我有一組數據和大約4千萬觀察值。 我想知道什麼是爲每個類選擇50個隨機元素或前50個元素的最佳/最快/最有效的方式(類只是一列)。選擇每個類的n元素

我列中的唯一類數約爲2k,我想選擇100,000個元素的子集,每個類有50個元素。

我在考慮將它們分組到課堂,然後遍歷每個組並選擇前50個元素,然後繼續到下一個組。

我想知道有沒有更好的方法來做到這一點?

回答

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考慮下面的數據幀

df = pd.DataFrame(np.random.rand(100, 2), columns=list('ab')) 
df['group'] = np.remainder(np.random.permutation(len(df)), 3) 

df.head() 

    a   b   group 
0 0.069140 0.553955 1 
1 0.564991 0.699645 2 
2 0.251304 0.516667 2 
3 0.962819 0.314219 2 
4 0.353382 0.500961 0 

您可以通過

df_randomized = df.ix[np.random.permutation(len(df))] 

df_randomized.head() 

    a   b   group 
90 0.734971 0.895469 0 
35 0.195013 0.566211 0 
27 0.370124 0.870052 2 
21 0.297194 0.500713 1 
66 0.319668 0.347365 2 

得到一個隨機版本要選擇N隨機元素,首先生成置換,減少它的大小。之後,它適用於數據框:

N = 10 
indexes = np.random.permutation(len(df))[:N] 
df_randomized = df.ix[indexes] 

要獲得各組您可以將數據幀的第N個元素和應用的方法來選擇前N個元素。不需要這裏的任何環的熊貓就可以搞定你:

N = 10 
df.groupby('group')\ 
    .apply(lambda x: x[:N][['a', 'b']]) 

所有的方法應該是快,因爲他們請使用numpy的或熊貓的內部優化的方法。

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IIUC你需要使用numpy.random.choice

import pandas as pd 
import numpy as np 

df = pd.DataFrame({'class': [0,1,2,3,0,1,2,3,0,1,2,3], 
       'value': [1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,1,12]}) 


Samplesize = 2 #number of samples that you want  
print df.groupby('class', as_index=False).apply(lambda array: array.loc[np.random.choice(array.index, Samplesize, False),:]) 

輸入

class value 
0  0  1 
1  1  2 
2  2  3 
3  3  4 
4  0  5 
5  1  6 
6  2  7 
7  3  8 
8  0  9 
9  1  10 
10  2  1 
11  3  12 

輸出

 class value 
0 8  0  9 
    0  0  1 
1 1  1  2 
    5  1  6 
2 6  2  7 
    10  2  1 
3 11  3  12 
    3  3  4 
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感謝您的回答,但是當我有一個觀察次數小於指定Samplesize的類時,我無法使用該解決方案。我發現ValueError:'replace = False'時不能取大於樣本的樣本 – sebb

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print df.groupby('class',as_index = False).apply(lambda array:array.loc [np.random.choice(array.index ,Samplesize,True),]]]) 使用這個,只記得當它是True時樣本可能有重複 – Shijo

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@sebb你說你想要每個類有50個元素。如果一個類的元素少於50個,那麼你不能這樣做,因此引發異常看起來是正確的。 – Goyo