如何構建空分佈

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1：我想要創建14.000個基因（行）和250個樣本（矩陣的列）的合成數據集。這可以怎麼做？
2：在此之後，我想推斷使用互信息算法的基因調控。我知道如何和事實上我有一個網絡。
3：我想知道我所擁有的網絡是否偶然到期。爲此，一種常見的方法是對樣本或基因進行1000次篩選，以創建1000個網絡並繪製空分佈以驗證之前（第2點）獲得的網絡。這被稱爲引導程序。還有其他方法嗎？如何構建空分佈

最佳，

來源

2012-09-21 Elb

此問題更適合[CrossValidated]（http://stats.stackexchange.com/），因爲它是純粹的統計問題。儘管你或我沒有足夠的聲望來遷移它。 – Backlin

非常感謝！這是一個很好的建議！ – Elb

在R中sample功能是構建現有數據的隨機置換的基本方法。目前還不清楚你想要什麼，還有一個想法是你可能只需要指出runif函數來生成隨機均勻序列。如果你有1000個對象中的對象矢量特定排序，OBJ：

sample(obj) # returns a permuted sequence 
# Same as ... 
obj[ sample(length(obj)) ]

無論是「零分配」是由你來決定。（並且要求所有在R中執行任何特定任務的方法都被視爲過分苛刻，通常有大量的方法，甚至要求「最好」會增加你獲得你的機會問題已關閉。）

來源

2012-09-21 19:19:42

嗨迪文，謝謝！問題在於，我認爲交叉驗證的方法只是一個混淆。例如。有bootstrap，leave-one-out ecc。 ECC。我需要一個簡短描述的「列表」，以更好地瞭解根據我的情況使用哪種方法。無論如何謝謝你建議我的「樣本」功能。 – Elb

不幸的是，有關於這個主題的書籍，你提供寶貴的小指導討論。 –

我完全同意你的看法。這對我來說是一個新領域，我只需要在這裏看到！ – Elb

如何構建空分佈

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