在Shiny中使用Cytoscape.js進行網絡可視化

Question

我正在開發用於網絡可視化的Web項目。我正在使用Shiny在R中編寫我的代碼。我想用Cytoscape.js顯示我的圖表

我在網上搜索了某種源代碼。但我找不到任何東西。 Cytoscape.js的網頁對我來說是不夠的，因爲我不是js的專家，也不能使用這些示例。

簡而言之，我有我的圖形的鄰接矩陣，並希望與cytoscpae.js一起使用它。你知道任何源代碼或我應該經歷的步驟教程嗎？

Answer 1

Cytoscape.js支持輸入的JSON，所以只要你的R/Shiny代碼能夠生成，你應該可以使用Cytoscape.js。這裏的描述的格式：http://cytoscape.github.io/cytoscape.js/#notation/elements-json

看起來有光澤有一組預定義支持小部件，所以這裏有幾個選項：

（1）光澤增加了對Cytoscape.js支持（如https://github.com/cytoscape/r-cytoscape.js ），

（2） Cytoscape.js插件是爲Shiny編寫的。

（3）您至少在您的應用的一部分使用JS。 （1）和（2）比（3）需要更多的時間，所以根據你的要求，你可能不得不咬住子彈並使用普通的JS。在沒有自己的JS的情況下使用像R/Shiny這樣的框架時，你總是被鎖定在任何支持的東西上，而錯過任何不是的東西 - 所以你失去了靈活性。

對於R和Cytoscape.js之間非常靈活和通用的互動，看到RCyjs project（docs）