MPI並行寫入TIFF文件

我正在嘗試在MPI代碼中寫入TIFF文件。不同的處理器具有不同的圖像部分，我想將圖像並行寫入文件。MPI並行寫入TIFF文件

的寫入失敗，只有第一處理器能夠寫入。

我該怎麼做？

有我的執行沒有錯誤，只是它不工作。
我用h=TIFFOpen(file, "a+")每個處理器上使用TIFFSetDirectory(h, directorynumber)打開同一個文件（我不知道這是否是一個正確的方式或沒有），那麼每個誰負責的目錄處理器將寫在了自己的位置的頭，然後每個目錄的內容將被寫入。我將用TIFFWriteDirectory(h)完成。結果將是寫在文件上的第一個目錄。

我想，我需要使用MPI_IO但這樣做的方式是不TIFFOpen打開文件？

來源

2014-01-28 ziv

你在想什麼？結果是什麼？什麼是錯誤？在我們能夠幫助您之前，我們需要更多信息。 –

並行libtiff是否有任何開源解決方案？真的很難相信沒有人會試圖爲tiff庫編寫並行IO。 – ziv

不同MPI任務是獨立的程序，從上來看OS點獨立主機上運行。在你的情況下，TIFF庫不是爲了處理並行操作而設計的，所以打開文件將導致第一個進程成功，其餘的都會失敗，因爲他們發現文件已經打開（在共享文件系統上）。除了在處理巨大的圖像（例如：天文圖像）的情況下，執行並行I/O對性能很重要（您需要支持它的文件系統......但我知道IBM GPFS），我會避免使用MPI_IO編寫自定義TIFF驅動程序。

取而代之的是典型的解決方案是收集（MPI_Gather（））與等級== 0過程中的圖像部分，讓它只保存TIFF文件。

來源

2014-01-30 10:53:33 Sigismondo

只是一個愚蠢的想法：也許爲圖像的每個塊寫一個文件，然後有一個簡單的合併塊的後構建步驟？實際上，這種方法可能需要一個定製的TIFF庫（這是OP可能使用的任何方式）...... –

並非毫無意義:) MPI並不總是最好的工具。但我期望後續是「如何收集圖像」 - 在這裏MPI數據類型可以有很大的幫助 - 它取決於圖像的分佈。 OP提到的庫只是[libtiff]（http://www.unix.com/man-page/all/3tiff/TIFFSetDirectory/）。 – Sigismondo

這是真的:)但是，傳遞塊可能會很慢...或者MPI知道如何將指針傳遞到內存中的位置？ MPI是否使用共享內存模型？ –

MPI並行寫入TIFF文件

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