在運行R CMD檢查時未找到R軟件包測試

我正在使用testthat軟件包爲我的R軟件包編寫測試。我遵循http://r-pkgs.had.co.nz/tests.html（我相信）的指示。我用在運行R CMD檢查時未找到R軟件包測試

devtools::use_testthat()

設置測試骨架。我在tests/testthat中創建了一個測試文件，文件名以test開頭。當我在RStudio中運行devtools::test()或Ctrl + Shift + T時，測試運行成功，但是當我運行R CMD check或Ctrl + Shift + E時，testthat找不到我的軟件包。我得到的錯誤

> library(testthat) 
> 
> test_check("foo") 
Loading required package: foo 
Error in loadNamespace(name) : there is no package called 'foo' 
Calls: test_check ... tryCatch -> tryCatchList -> tryCatchOne -> <Anonymous> 
In addition: Warning message: 
In library(package, lib.loc = lib.loc, character.only = TRUE, logical.return = TRUE, : 
    there is no package called 'foo' 
Execution halted

我在我的.Renviron文件中設置R_LIBS_SITE修改我的庫路徑。我懷疑這在運行R CMD check時沒有被讀取，但我認爲它不應該有所作爲。

當我從RStudio控制檯運行devtools::check()時，它成功完成（包括測試），但運行檢查RStudio失敗。

我加了一些調試testthat.R打印出來.libPaths()等位：

> library(testthat) 
> .libPaths() 
[1] "C:/Users/timk/AppData/Local/Temp/Rtmp841w0b/RLIBS_1790551706" 
[2] "C:/Program Files/R/R-3.2.2/library" 
> list.files(.libPaths()[1]) 
[1] "KernSmooth" "MASS"  "Matrix"  "boot"  "class" 
[6] "cluster" "crayon"  "digest"  "foo"  "foreign" 
[11] "lattice" "magrittr" "memoise" "mgcv"  "nlme" 
[16] "nnet"  "praise"  "rpart"  "spatial" "stringi" 
[21] "stringr" "survival" "testthat" 
> list.files(file.path(.libPaths()[1], "foo")) 
character(0) 
> list.files(file.path(.libPaths()[1], "testthat")) 
[1] "CITATION" "DESCRIPTION" "INDEX"  "LICENSE"  "MD5" 
[6] "Meta"  "NAMESPACE" "R"   "help"  "html" 
[11] "libs"

你可以看到，包目錄在臨時圖書館創建，但包是空的。將其與testthat的文件列表進行比較。

我也嘗試下載使用testthat（anonymizer）的另一個包，並且得到相同的錯誤。

sessionInfo()：

R version 3.2.2 (2015-08-14) 
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit) 
Running under: Windows 8 x64 (build 9200) 

locale: 
[1] LC_COLLATE=English_Australia.1252 LC_CTYPE=English_Australia.1252 LC_MONETARY=English_Australia.1252 
[4] LC_NUMERIC=C      LC_TIME=English_Australia.1252  

attached base packages: 
[1] stats  graphics grDevices utils  datasets methods base  

other attached packages: 
[1] foo_0.1 testthat_0.11.0 

loaded via a namespace (and not attached): 
[1] magrittr_1.5 tools_3.2.2 roxygen2_5.0.0 Rcpp_0.12.1 crayon_1.3.1 memoise_0.2.1 stringi_1.0-1 
[8] stringr_1.0.0 digest_0.6.8 devtools_1.9.1

來源

2015-11-20 Tim Keighley

幾天前我在'adegenet'的一個分支上運行檢查，並且所有地獄都輸了。在用戶環境路徑中添加'R_LIBS_USER'後，事情就會發生。你的'.libPaths（）'說什麼？ –

一個很好的問題。我添加了輸出以顯示'.libPaths（）'和臨時庫的內容。軟件包目錄正在創建，但它是空的。 –

您是否嘗試將'R_LIB_USER'添加到用戶環境或刪除第一個（臨時）文件夾？ –