創建從Fortran源代碼一個Python模塊使用痛飲

我在涉及創建Fortran語言編寫的程序的Python接口的一個項目工作。我做了一些研究並決定使用SWIG，首先將Fortran例程暴露給C++，然後用SWIG包裝它們。但是，我無法使Python模塊正常工作。創建從Fortran源代碼一個Python模塊使用痛飲

作爲一個例子，我有這樣的Fortran函數：

function sum_array(input_array, length) result(sum) 

implicit none 

integer, value, intent(in) :: length 
real(kind=8), intent(in), dimension(length) :: input_array 

real(kind=8) :: sum 
integer :: i 

sum = 0.0 

do i=1, length 
    sum = sum + input_array(i) 
end do 

end function sum_array

隨着C聲明：

double sum_array(double* input_array, int length);

我使用的SWIG接口文件是：

%module sum_array 

%{ 
    #define SWIG_FILE_WITH_INIT 
    #include "sum_array.h" 
%} 

%include "numpy.i" 

%init %{ 
    import_array(); 
%} 

%apply (double* IN_ARRAY1, int DIM1) {(double* input_array, int length)}; 

%include "sum_array.h"

該接口文件使用numpy.i接口。

我編譯代碼（用make）到一個共享對象，如下所示：

$ swig -python -c++ -o sum_array_wrap.cpp sum_array.i 
$ gfortran -c sum_array.f90 -o sum_array.o -fpic -fno-underscoring 
$ gcc -I/usr/include/python2.7 -c sum_array_wrap.cpp -o sum_array_wrap.o -fpic -std=c++0x 
$ gfortran sum_array_wrap.o sum_array.o -o _sum_array.so -shared -Wl,-soname,_sum_array.so -lstdc++

當我嘗試導入在Python模塊，我得到「NameError：名字‘sum_array’沒有定義」來自：

from numpy.random import rand 
from _sum_array import * 

input_array = rand(5) 
sum = sum_array(input_array)

從我在翻譯的幫助（）得到的信息，我相信在連接不包括在庫中的sum_array功能，我認爲這是問題。

關於如何使這項工作的任何想法？

順便說一句，關於其他的工具，而不是痛飲建議十分歡迎，因爲這是我第一次這樣做，我試圖做的正是這樣一個唯一的出路。

來源

2016-01-02 Manolo

什麼變量或函數（如果有的話）執行'_sum_array'導入？ – hpaulj

你是說當我用Python導入模塊？這似乎是空的，我想鏈接沒有找到功能sum_array的聲明... – Manolo

這回問題出在name mangling。該FORTRAN sompiler不使用它，所以出口符號名是sym_array，但後來您編譯C++接口，因此鏈接希望看到類似_Z9sum_arrayPdi。解決方案是將標題內容封裝到

#ifdef __cplusplus 
extern "C" { 
#endif 

double sum_array(double* input_array, int length); 

#ifdef __cplusplus 
} 
#endif

來源

2016-01-02 18:51:46

我的壞，該行是錯誤的，我沒有使用它，雖然，我加的是要避免警告編譯時Python界面。當我使用.i文件，而不該行我讓「導入錯誤：/home/manuel/Documents/typemaps/fortran/_sum_array.so：未定義的符號：_Z9sum_arrayPdi 」要導入的模塊在解釋的時候。 – Manolo

這意味着'sum_array'的依賴關係沒有解析。如果您使用正確的來源更新帖子，我可能會幫助你。 –

我修復了界面文件，但仍然無法正常工作。 – Manolo

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