如何在某些行上替換以某些字符開頭的單詞？

Question

我想用SED命令從我的文件中替換/刪除rs數字。 我有一個VCF文件：

##reference=file:/hs37d5.fasta 

#CHROM POS  ID  REF  ALT  QUAL FILTER INFO FORMAT SC_PCHD5235298 

1  10234 rs145599635  C  T  153.34 . 

我想更換RS *條目僅在所不以＃開頭的行， 例如，我想用一個點來代替rs145599635。並希望它忽略以＃開頭的行。

我試圖

sed "/^[^#]/s/rs.*/./g" test.vcf 

，但它的RS後刪除所有內容。

Answer 1

你可以用這個試試，

例：

sed -i 's/\(^[^#].*\)rs[0-9]\+\(.*\)/\1rs.\2/' test.vcf 

我改變你的command.You要這樣寫。

sed -i "/^[^#]/s/rs[0-9]\+/rs./g" test.vcf 

我的test.vcf文件看起來像這樣。我認爲你的文件只是這個樣子。

##reference=file:/hs37d5.fasta 

    #rs145599635 C T 153.34 . 
    #1 10234 rs145599635 C T 153.34 . 
    #CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT SC_PCHD5235298 

    1 10234 rs145599635 C T 153.34 . 

我希望這會幫助你。