2017-07-31 65 views
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我想從具有不同數量的列的文本文件導入數據。我知道第一列始終是一個int,隨後的列將在所有文件中浮動。我怎樣才能明確指定使用dtypes?genfromtxt不同的數據類型

dtypes=[int,float,float,float...] #this number will change depending on the number of columns in the file 

data=np.genfromtxt(file,dtype=dtypes,delimiter='\t',skip_header=11) #read in 
the data 

感謝

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你能發表你輸入文件的頭幾行和你收到的錯誤信息嗎? –

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'dtype = None'會爲你工作嗎?或者將dtype保留爲默認浮點數並獲得一個2d數組而不是結構化數組。 – hpaulj

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我想要一個二維數組作爲後來我想切片的數據和改變某些列。我可以將它保留爲浮點數,但是我正在編寫新文件,並希望儘可能地減小文件大小,只要可能,將數字減少到int。 –

回答

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你可以先閱讀一切,floats和數組轉換爲structured array,你知道後你多少列有:

##input.txt: 
## 1 1.4 5e23 
## 2 2.3 5e-12 
## 3 5.7 -1.3e-2 

import numpy as np 

data = np.genfromtxt('input.txt') 
print(data) 
print('-'*50) 

colw = data.shape[1] 

dtypes = [('col0', int)]+[('col{}'.format(i+1),float) for i in range(colw-1)] 
print(dtypes) 
print('-'*50) 

converted_data = np.array([tuple(r) for r in data], dtype = dtypes) 

print(converted_data) 

這給出了以下的輸出:

[[ 1.00000000e+00 1.40000000e+00 5.00000000e+23] 
[ 2.00000000e+00 2.30000000e+00 5.00000000e-12] 
[ 3.00000000e+00 5.70000000e+00 -1.30000000e-02]] 
-------------------------------------------------- 
[('col0', <class 'int'>), ('col1', <class 'float'>), ('col2', <class 'float'>)] 
-------------------------------------------------- 
[(1, 1.4, 5.00000000e+23) (2, 2.3, 5.00000000e-12) 
(3, 5.7, -1.30000000e-02)] 

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