增加堆棧大小

我正在做巨大數組的計算，對於這些計算中的一些，我需要增加堆棧大小！在我的〜/ .bashrc中將堆棧大小設置爲無限制（ulimit -s unlimited）有什麼不利嗎？增加堆棧大小

該程序使用Fortran編寫（F77 & F90）並與MPI並行化。我的一些陣列有超過2E7條目，當我使用MPI的少量內核時，它會與segmentation fault崩潰。

數組大小保持在整個計算同樣，因此我設置好的他們修正值：

real   :: p(200,200,400) 
integer  :: ib,ie,jb,je,kb,ke 
... 
ib=1;ie=199 
jb=2;je=198 
kb=2;ke=398 
call SOLVE_POI_EQ(rank,p(ib:ie,jb:je,kb:ke),R)

2015-08-28 chi86

你正在運行什麼樣的軟件？在哪種編程語言？你在編碼嗎？你能否顯示一些源代碼（所以**編輯你的問題**以改善它）？ –

Fortran77，Fortran90，Fortran2006？顯示處理（並分配）巨大數組的實際代碼。 –

將堆棧大小設置爲無限可能不會對您有所幫助。您正在堆棧中分配64MB的大塊，並且可能不會從頂部填充，而是從底部填充。

這很重要，因爲操作系統隨着您的增長而增長。只要它檢測到堆棧段下方的頁面錯誤，就會認爲您需要更多空間，並靜靜地插入新頁面。儘管如此，你的地址空間中這個觸發區的大小是有限的，我懷疑它大於64 MB。由於您的索引變量可能位於堆棧之下的數組之下，因此訪問它們已經導致64 MB跳躍，從而導致您的進程崩潰。

只要讓你的數組allocatable，添加相應的allocate()聲明，你應該沒問題。

2015-08-31 05:36:17 cmaster

我一直認爲在運行時數組大小發生變化時會使用'allocatable'數組嗎？我從一開始就修好了，在整個計算過程中保持不變！ – chi86

您可以使用'allocatable'來創建動態大小的數組，但它也可以避免大的堆棧分配。一個可分配數組總是分配在沒有堆棧限制的堆上。而'allocate（）'語句不會抱怨，如果你傳遞一個編譯時間常量;-) – cmaster

好吧，這是有道理的，那麼我會這樣做！謝謝 – chi86

堆棧大小是從來沒有真正無限的，所以你還是會有一些故障。而且你的代碼仍然不能移植到小型（或普通大小）堆棧的Linux系統上。

順便說一句，你應該說明你正在運行哪種程序，顯示一些源代碼。

如果使用C++編碼，使用標準containers應該會有很大的幫助（關於實際的堆棧消耗）。例如，本地（已分配堆棧）std::vector<int> v(10000);（而不是int v[10000];）將其數據分配到堆上（並且在從定義它的塊中退出時由析構函數釋放）

改進程序會好得多以避免過多的堆棧消耗。需要大量的堆棧空間實際上是一個你應該嘗試糾正的錯誤。典型的經驗法則是讓01小於幾千字節（因此在堆上分配任何更大的數據）。

你也許還可以考慮使用Boehm conservative garbage collector：你會使用GC_MALLOC代替malloc（你會堆上分配使用GC_MALLOC大數據結構），但你不會費心去free你（GC-堆allcoated）數據。

2015-08-28 05:23:02

我編輯了我的問題！我的代碼最重要的是減少計算時間。數組總是保持相同的大小，因此我將它設置爲固定值！ – chi86

分配堆中的數組不應該改變CPU的時間。 –

好吧，但我沒有看到優勢，如果我創建它們時將其設置爲固定值。或者是'p（ib：ie，jb：je，kb：ke）'這個問題？ – chi86

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